67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2400 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2400  protein of unknown function DUF82  100 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3352  protein of unknown function DUF82  44.49 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.729294  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10590  hypothetical protein  40.51 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18585e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  40.59 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  42.37 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0147  hypothetical protein  38.94 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0149  hypothetical protein  38.94 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3276  protein of unknown function DUF82  43.93 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.31629  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  39.09 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0859  hypothetical protein  39.75 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.015676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0327  hypothetical protein  40.34 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359144  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  40.59 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  40.19 
 
 		 247 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  36.02 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3040  protein of unknown function DUF82  33.9 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3080  protein of unknown function DUF82  33.9 
 
 		 261 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.367373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  38.14 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1285  hypothetical protein  35.94 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  37.08 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  37.83 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  40 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1548  hypothetical protein  39.46 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0306  hypothetical protein  40.87 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00785467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2800  hypothetical protein  40.87 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3405  hypothetical protein  39.57 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000396149  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0209  hypothetical protein  38.62 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121486  unclonable  0.00000000000711775 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  35.71 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  35.71 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  35.71 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  36.02 
 
 		 251 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4339  protein of unknown function DUF82  36.82 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.172322 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4229  protein of unknown function DUF82  36.82 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  35 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0225  hypothetical protein  39.22 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3958  protein of unknown function DUF82  37.66 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  39.44 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1812  protein of unknown function DUF82  40.44 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1519  hypothetical protein  38.21 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00627759  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0233  hypothetical protein  38.1 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0265996  hitchhiker  0.00000000670922 
 
 
-
 
NC_003296  RS02617  hypothetical protein  37.91 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2002  protein of unknown function DUF82  35.56 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7452  protein of unknown function DUF82  36.89 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0100  protein of unknown function DUF82  42.42 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.566034  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_368  hypothetical protein  38.93 
 
 		 167 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0577491  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0403  hypothetical protein  39.07 
 
 		 167 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.393997  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0341  protein of unknown function DUF82  34.87 
 
 		 158 aa  102  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00210637  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1425  hypothetical protein  28.48 
 
 		 164 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  34.51 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1471  hypothetical protein  28.29 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.863306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1033  hypothetical protein  32.19 
 
 		 148 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3160  hypothetical protein  37.59 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0072  hypothetical protein  29.45 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0153972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0758  hypothetical protein  30.07 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0155  hypothetical protein  31.43 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.292503  normal  0.0192044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1962  protein of unknown function DUF82  31.33 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000351454  decreased coverage  0.00501017 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0872  protein of unknown function DUF82  33.11 
 
 		 149 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1175  protein of unknown function DUF82  24.11 
 
 		 176 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  26.57 
 
 		 145 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0747  hypothetical protein  30.46 
 
 		 192 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1167  hypothetical protein  32.06 
 
 		 126 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1691  hypothetical protein  26.86 
 
 		 193 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1701  thiamineS protein  33.33 
 
 		 91 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00127323  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2987  protein of unknown function DUF82  32.68 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  40.91 
 
 		 79 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0441  protein of unknown function DUF82  30.86 
 
 		 179 aa  42  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.297493 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2635  protein of unknown function DUF82  30.26 
 
 		 158 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1591  hypothetical protein  30.3 
 
 		 162 aa  42  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>