69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2362 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2362  ATPase  100 
 
 		 464 aa  959    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  49.78 
 
 		 462 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  47.28 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  39.57 
 
 		 458 aa  298  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  36.66 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  37.89 
 
 		 460 aa  296  5e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  34.96 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  38.22 
 
 		 463 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  37.25 
 
 		 464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  34.26 
 
 		 461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  35.13 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  32.68 
 
 		 470 aa  259  8e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  35.13 
 
 		 463 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  33.1 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  33.55 
 
 		 473 aa  250  5e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  34.4 
 
 		 496 aa  245  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  34.25 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  34.63 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  33.19 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  30.8 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  33.02 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  32.58 
 
 		 450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  37.5 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  29.21 
 
 		 469 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  31.91 
 
 		 462 aa  207  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  28.87 
 
 		 471 aa  205  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  30.82 
 
 		 420 aa  192  9e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  30.21 
 
 		 456 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  32.9 
 
 		 439 aa  186  7e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  32.66 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  33.15 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  28.11 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  24.95 
 
 		 509 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  28.29 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  27.95 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  30.39 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  27.84 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  28.35 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  27.4 
 
 		 487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  28.35 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  26.5 
 
 		 475 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  26.71 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  24.77 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  27.05 
 
 		 498 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  27.6 
 
 		 476 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.33 
 
 		 474 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  24.93 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  28.28 
 
 		 313 aa  90.5  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  24.24 
 
 		 501 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  26.06 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  27.37 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  24.82 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  27.91 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  21.02 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  25.45 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  26.15 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  25.45 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  24.73 
 
 		 292 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  27.27 
 
 		 277 aa  54.7  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  35.82 
 
 		 105 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  27.38 
 
 		 261 aa  52.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  31.46 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  32.62 
 
 		 342 aa  47.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  23.67 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 120 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  23.74 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  35 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  34.07 
 
 		 350 aa  43.9  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  25.93 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>