More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2331 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
377 aa  767    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2232  extracellular ligand-binding receptor  41.33 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.71 
 
 
382 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  37.1 
 
 
372 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2773  Extracellular ligand-binding receptor  38.78 
 
 
413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0744  Extracellular ligand-binding receptor  35.49 
 
 
381 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2831  substrate-binding protein, putative  37.83 
 
 
375 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00332473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0532  Extracellular ligand-binding receptor  36.01 
 
 
370 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0390708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2947  extracellular ligand-binding receptor  32.49 
 
 
367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.752891  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0561  Extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 
368 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.378991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
384 aa  136  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.53 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
404 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.35 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.17 
 
 
397 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 
402 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
397 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 
405 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
376 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
381 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 
376 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  25.64 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  28.22 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.81 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
380 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
419 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 
383 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 
386 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 
386 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  31.21 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.83 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  26.35 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.29 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 
384 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 
393 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
381 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.82 
 
 
399 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
384 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.89 
 
 
384 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
384 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  24.45 
 
 
387 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.03 
 
 
378 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
373 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
373 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
387 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 
382 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 
386 aa  106  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
373 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
384 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.14 
 
 
380 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 
380 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
399 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 
399 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 
391 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 
380 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 
391 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
375 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
373 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 
386 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 
383 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 
372 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
388 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
373 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 
400 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
388 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
373 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 
381 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  26.67 
 
 
380 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 
371 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.83 
 
 
380 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.67 
 
 
380 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.67 
 
 
380 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 
366 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.67 
 
 
376 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.67 
 
 
380 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 
384 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 
380 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.67 
 
 
380 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.67 
 
 
380 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
368 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
382 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 
390 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
381 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  23.8 
 
 
372 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  23.29 
 
 
375 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
383 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>