97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2305 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 
389 aa  797  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  33.51 
 
 
383 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  33.51 
 
 
408 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  31.84 
 
 
400 aa  164  2e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  30.85 
 
 
417 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  30.46 
 
 
401 aa  154  3e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  30.51 
 
 
395 aa  139  8e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  29.17 
 
 
379 aa  136  6e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  27.3 
 
 
381 aa  136  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  28.23 
 
 
395 aa  134  2e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  27.17 
 
 
365 aa  132  1e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  27.78 
 
 
1101 aa  127  2e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  27.03 
 
 
387 aa  121  2e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  26.67 
 
 
373 aa  119  8e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  26.67 
 
 
377 aa  119  8e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  24.44 
 
 
387 aa  115  1e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  24.54 
 
 
376 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  8.47515e-09 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  25.18 
 
 
427 aa  111  2e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  24.17 
 
 
387 aa  110  4e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  23.58 
 
 
396 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  23.02 
 
 
402 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  22.08 
 
 
396 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33222e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  25.76 
 
 
379 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  26.24 
 
 
1852 aa  89.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  24.69 
 
 
350 aa  85.1  2e-15  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  4.43325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  25.14 
 
 
379 aa  84.3  3e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  20.22 
 
 
396 aa  84.7  3e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  20.49 
 
 
396 aa  82.4  1e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  25.1 
 
 
375 aa  82.4  1e-14  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  24.86 
 
 
447 aa  81.6  2e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  26.89 
 
 
416 aa  80.5  5e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  24.22 
 
 
400 aa  75.9  1e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  26.26 
 
 
399 aa  72  2e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  23.36 
 
 
933 aa  70.1  6e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  22.43 
 
 
464 aa  68.9  1e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  25.22 
 
 
386 aa  68.9  2e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  19.71 
 
 
468 aa  65.9  1e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  21.96 
 
 
460 aa  65.5  2e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  27.27 
 
 
501 aa  64.7  2e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  27.97 
 
 
405 aa  65.1  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  23.9 
 
 
629 aa  63.9  4e-09  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  24.09 
 
 
368 aa  62.4  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  23.73 
 
 
389 aa  61.6  2e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  23.53 
 
 
390 aa  60.8  3e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  24.77 
 
 
392 aa  60.8  4e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  25.76 
 
 
378 aa  60.8  4e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  23.53 
 
 
390 aa  60.1  7e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  22.55 
 
 
381 aa  60.1  7e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  25.31 
 
 
467 aa  59.3  1e-07  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  26.53 
 
 
384 aa  59.3  1e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  24.69 
 
 
467 aa  58.9  1e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  23.98 
 
 
400 aa  58.9  2e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 
402 aa  58.5  2e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  22.14 
 
 
382 aa  58.5  2e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  24.07 
 
 
394 aa  58.2  3e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  27.69 
 
 
384 aa  58.2  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  27.69 
 
 
392 aa  57.8  3e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  27.69 
 
 
392 aa  57.8  3e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  23.4 
 
 
385 aa  57.8  3e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  27.69 
 
 
392 aa  57.8  3e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  27.69 
 
 
392 aa  57.8  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  27.69 
 
 
384 aa  58.2  3e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  27.69 
 
 
392 aa  57.8  3e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  30.46 
 
 
386 aa  57.4  4e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  24.55 
 
 
379 aa  57  5e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  24.07 
 
 
468 aa  57  6e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  25.26 
 
 
396 aa  55.8  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  22.88 
 
 
512 aa  55.5  2e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  22.97 
 
 
371 aa  54.3  3e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  22.98 
 
 
931 aa  54.7  3e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  20.87 
 
 
932 aa  53.9  5e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  26.05 
 
 
398 aa  51.6  2e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  23.91 
 
 
377 aa  51.2  3e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  21.88 
 
 
395 aa  51.2  3e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  24.24 
 
 
386 aa  50.8  4e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  24.24 
 
 
386 aa  50.4  5e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  22.32 
 
 
389 aa  50.4  5e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  23.1 
 
 
374 aa  49.7  8e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  22.46 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  23.89 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  23.15 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  24.09 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  20.53 
 
 
934 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  21.31 
 
 
382 aa  46.6  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  23.62 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2389  GGDEF family protein  26.07 
 
 
829 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  25.69 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  23.08 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  25.42 
 
 
385 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3873  hypothetical protein  24.61 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  24.32 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  23.38 
 
 
387 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  21.97 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  23.38 
 
 
387 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  24.02 
 
 
398 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  21.02 
 
 
391 aa  43.5  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  23.57 
 
 
387 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>