More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2251 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2251  serine dehydratase alpha chain  100 
 
 		 454 aa  915    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.472865  normal  0.778553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2740  serine dehydratase alpha chain  51.54 
 
 		 460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000127179  hitchhiker  0.000000403127 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0011  serine dehydratase alpha chain  55.41 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1086  serine dehydratase alpha chain  47.37 
 
 		 502 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.787533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  45.32 
 
 		 468 aa  356  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  44.25 
 
 		 458 aa  353  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  42.83 
 
 		 458 aa  349  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  43.31 
 
 		 458 aa  349  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0982  L-serine ammonia-lyase  46.58 
 
 		 459 aa  349  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  43.1 
 
 		 458 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  43.1 
 
 		 458 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  44.59 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  42.73 
 
 		 458 aa  346  5e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0527  L-serine dehydratase 1  45.55 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  42.95 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  42.98 
 
 		 458 aa  341  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  44.85 
 
 		 458 aa  339  5.9999999999999996e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  42.18 
 
 		 458 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  42.86 
 
 		 458 aa  339  8e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  44.64 
 
 		 458 aa  338  9e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  44.63 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  41.97 
 
 		 458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  42.18 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  42.18 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  42.18 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  42.18 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  44.7 
 
 		 461 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  44.7 
 
 		 461 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  44.04 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  44.07 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  44.7 
 
 		 529 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4831  L-serine ammonia-lyase  43.79 
 
 		 462 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  44.99 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  44.47 
 
 		 458 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  42.52 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0288  L-serine ammonia-lyase  43.64 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1902  L-serine dehydratase  43.64 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.457679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  43.06 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  43.2 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1955  L-serine ammonia-lyase  44.78 
 
 		 504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5070  L-serine dehydratase 1  43.43 
 
 		 461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  42.55 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  43.43 
 
 		 461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  43.2 
 
 		 458 aa  327  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0082  L-serine ammonia-lyase  44.04 
 
 		 489 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  43.72 
 
 		 458 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  43.43 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1863  L-serine ammonia-lyase  44.56 
 
 		 504 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0396  L-serine ammonia-lyase  44.56 
 
 		 545 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0920  L-serine ammonia-lyase  43.75 
 
 		 458 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  43.01 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  43.82 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  42.43 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6165  L-serine dehydratase  45.34 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  43.59 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  43.19 
 
 		 469 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71060  L-serine dehydratase  45.18 
 
 		 458 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3522  Iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase single chain form  43.6 
 
 		 458 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  44.42 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  44.42 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  44.73 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  45.55 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  43.94 
 
 		 458 aa  319  7e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0297  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  44.06 
 
 		 458 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3038  L-serine ammonia-lyase  44.16 
 
 		 459 aa  318  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.883779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0139  L-serine dehydratase 1  43.71 
 
 		 462 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0317  L-serine dehydratase 1  44.06 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1886  L-serine dehydratase 1  43.6 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  42.24 
 
 		 462 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0518  L-serine dehydratase 1  43.79 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  43.79 
 
 		 455 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  44.26 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  44.21 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1601  L-serine ammonia-lyase  42.95 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  42.17 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  45.53 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0129  L-serine dehydratase 1  43.68 
 
 		 462 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0141  L-serine dehydratase 1  43.68 
 
 		 462 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0322  L-serine dehydratase 1  44.06 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0213  L-serine dehydratase 1  43.32 
 
 		 462 aa  316  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1473  L-serine ammonia-lyase  44.37 
 
 		 461 aa  316  6e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0162786  normal  0.053495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4911  L-serine dehydratase 1  44.42 
 
 		 458 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  43.35 
 
 		 462 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0772  L-serine dehydratase 1  41.76 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5237  L-serine ammonia-lyase  43.38 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  42.58 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2913  L-serine dehydratase 1  43.25 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0859  L-serine ammonia-lyase  44.13 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5047  L-serine dehydratase 1  42.19 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.533739  normal  0.269496 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0142  L-serine dehydratase 1  43.25 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0155  L-serine dehydratase 1  43.25 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  43.16 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  44.16 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  43.36 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3164  L-serine dehydratase 1  43.17 
 
 		 458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3321  L-serine ammonia-lyase  42.89 
 
 		 462 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  45.14 
 
 		 473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  44.52 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  42.98 
 
 		 458 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0864  L-serine dehydratase 1  42.89 
 
 		 455 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>