281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2221 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 283 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  47.88 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  47.51 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  48.33 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  44.96 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  48.02 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  31.72 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 		 359 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  35.85 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  34.98 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  37.95 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  37.95 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  34.14 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  32.84 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  35.16 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  39.37 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  35.24 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  34.98 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 		 357 aa  112  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  31.19 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  26.49 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  31.75 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 329 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 330 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  30.84 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.75 
 
 		 288 aa  98.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  34.67 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  31.31 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  32.89 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 		 286 aa  92.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  30.2 
 
 		 356 aa  92  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  31.79 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  28.24 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  33.52 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.19 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  28.69 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  31.02 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 		 359 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  30.49 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  35.2 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  29.78 
 
 		 280 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  29.23 
 
 		 355 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.47 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  34.45 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 		 358 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 		 358 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 		 358 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 		 326 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  37.04 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  29.37 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  30.4 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  29.86 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 		 324 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  29.37 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  29.37 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  31.5 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  27.12 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  29.9 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  26.81 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>