More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2219 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  56.03 
 
 		 597 aa  659    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 600 aa  1225    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  53.83 
 
 		 602 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  51.1 
 
 		 755 aa  635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  52.13 
 
 		 595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  48.81 
 
 		 640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  37.24 
 
 		 647 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  39.07 
 
 		 639 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  36.73 
 
 		 645 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  39.07 
 
 		 643 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  38.22 
 
 		 636 aa  415  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  38.2 
 
 		 634 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  37.56 
 
 		 646 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  38.53 
 
 		 642 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  38.75 
 
 		 619 aa  392  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  38.88 
 
 		 611 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  37.52 
 
 		 640 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  36.41 
 
 		 609 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  37.59 
 
 		 681 aa  362  8e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  34.82 
 
 		 574 aa  356  7.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.81 
 
 		 633 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  36.24 
 
 		 643 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  35.68 
 
 		 647 aa  353  7e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.68 
 
 		 619 aa  352  8.999999999999999e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 610 aa  351  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  35.88 
 
 		 648 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  35.88 
 
 		 648 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  35.24 
 
 		 648 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  36.22 
 
 		 628 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  36.18 
 
 		 632 aa  348  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  36.88 
 
 		 626 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 		 630 aa  347  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.83 
 
 		 628 aa  346  6e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  35.84 
 
 		 640 aa  346  8e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 		 618 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 		 618 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 		 618 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  34.39 
 
 		 618 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  38.12 
 
 		 630 aa  345  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 618 aa  345  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 618 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 618 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 618 aa  343  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  35.52 
 
 		 629 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  33.89 
 
 		 618 aa  342  9e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  34.63 
 
 		 624 aa  342  9e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 618 aa  342  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  34.49 
 
 		 610 aa  342  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  36.91 
 
 		 662 aa  342  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 627 aa  342  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  34.28 
 
 		 618 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  34.3 
 
 		 691 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.15 
 
 		 618 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 		 645 aa  339  7e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  36.64 
 
 		 646 aa  339  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  35.55 
 
 		 631 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  33.9 
 
 		 637 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  32.68 
 
 		 632 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  38.06 
 
 		 586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 		 625 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  35.51 
 
 		 681 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  35.35 
 
 		 629 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  35.34 
 
 		 629 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.93 
 
 		 641 aa  337  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  34.38 
 
 		 652 aa  336  5.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  35.15 
 
 		 627 aa  336  5.999999999999999e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  36.09 
 
 		 630 aa  336  7e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  35.35 
 
 		 629 aa  336  9e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  35.19 
 
 		 631 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 		 636 aa  335  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  34.69 
 
 		 637 aa  334  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 		 607 aa  333  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  32.78 
 
 		 638 aa  333  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  36.13 
 
 		 646 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 		 602 aa  332  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 		 602 aa  332  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 		 648 aa  329  7e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 		 626 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 646 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  34.8 
 
 		 618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 		 703 aa  327  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  34.58 
 
 		 662 aa  327  5e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  35.36 
 
 		 631 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  34.09 
 
 		 801 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  32.67 
 
 		 608 aa  325  2e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 		 631 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 		 664 aa  325  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 649 aa  325  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 673 aa  324  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  33.61 
 
 		 634 aa  323  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 		 678 aa  323  5e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 		 618 aa  323  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  33.67 
 
 		 634 aa  323  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  34.38 
 
 		 638 aa  322  8e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 630 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 		 634 aa  321  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  33.1 
 
 		 601 aa  320  5e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  33.78 
 
 		 631 aa  320  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  32.64 
 
 		 599 aa  319  9e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  33.78 
 
 		 631 aa  319  9e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>