More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2218 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 373 aa  736    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  66.4 
 
 		 371 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  65.12 
 
 		 369 aa  491  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  66.12 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  63.69 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  59.95 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  48.92 
 
 		 366 aa  315  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  48.38 
 
 		 366 aa  315  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  48.37 
 
 		 366 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  49.73 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  46.9 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  47.84 
 
 		 365 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  44.5 
 
 		 366 aa  285  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  42.36 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  43.51 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  41.22 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 		 365 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  39.68 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  39.35 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  40.22 
 
 		 378 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.9 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  40.22 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  40.16 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  39.57 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  39.67 
 
 		 373 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  40.38 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  40.37 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  40.37 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 369 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  38.72 
 
 		 367 aa  229  7e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  39.67 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  40.05 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  38.01 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  39.95 
 
 		 379 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  37.03 
 
 		 372 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  39.78 
 
 		 367 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  39.78 
 
 		 367 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  39.08 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  38.36 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  41.32 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  40.18 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  40.31 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  41.92 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  38.96 
 
 		 368 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  38.96 
 
 		 368 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  38.96 
 
 		 368 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  36.46 
 
 		 374 aa  225  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  38.96 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  39.24 
 
 		 367 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  40.91 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  38.48 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  37.09 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  41.4 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  42.08 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  38.92 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  40.27 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  37.98 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 366 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  38.5 
 
 		 370 aa  219  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  36.68 
 
 		 421 aa  219  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  39.42 
 
 		 364 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  39.73 
 
 		 373 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  36.77 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  35.11 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  35.11 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  36.77 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  38.1 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  36.77 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  38.69 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  40.92 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  39.24 
 
 		 376 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  39.32 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  39.83 
 
 		 374 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  34.8 
 
 		 426 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  35.11 
 
 		 419 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  40.64 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  44.33 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  37.63 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  42.09 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  36.51 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  42.09 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  37.86 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  37.86 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  39.51 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  36.41 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  39.51 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  39.51 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2103  cell cycle protein FtsW  37.23 
 
 		 374 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000319192  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  36.51 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  36.32 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  38.63 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  36.51 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 380 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  37.9 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  39.73 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  32.16 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>