More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2213 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
289 aa  597  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.72 
 
 
291 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.24 
 
 
290 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  67.13 
 
 
290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.55 
 
 
293 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.12 
 
 
294 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50 
 
 
298 aa  277  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  46.58 
 
 
292 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.56 
 
 
295 aa  264  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
291 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  44.03 
 
 
297 aa  259  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.98 
 
 
283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.52 
 
 
291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  45.05 
 
 
295 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.55 
 
 
290 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.21 
 
 
283 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.32 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.83 
 
 
282 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  43 
 
 
294 aa  251  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.18 
 
 
290 aa  248  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.76 
 
 
287 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.21 
 
 
292 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.91 
 
 
287 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.56 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.96 
 
 
288 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.25 
 
 
288 aa  241  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.52 
 
 
287 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  40.79 
 
 
309 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
287 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.52 
 
 
288 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.52 
 
 
288 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.45 
 
 
281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
290 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 
290 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
293 aa  234  9e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.56 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  41.1 
 
 
293 aa  229  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.92 
 
 
289 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.79 
 
 
298 aa  228  8e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 
288 aa  227  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.06 
 
 
288 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.06 
 
 
288 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 
288 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
295 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.06 
 
 
288 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  40.42 
 
 
287 aa  225  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
290 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.91 
 
 
296 aa  223  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 
291 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  44.52 
 
 
287 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.19 
 
 
291 aa  222  7e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.62 
 
 
290 aa  221  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  37.93 
 
 
345 aa  219  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 
290 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  36.24 
 
 
286 aa  218  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.24 
 
 
290 aa  218  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 
289 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.44 
 
 
290 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  39.86 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
289 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 
292 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.18 
 
 
291 aa  215  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.69 
 
 
294 aa  215  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  40.33 
 
 
295 aa  215  8e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  40.27 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.12 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.12 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  40.21 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.13 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.69 
 
 
286 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.69 
 
 
286 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
286 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.89 
 
 
287 aa  211  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  37.02 
 
 
294 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  38.16 
 
 
305 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 
292 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.2 
 
 
293 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  38.57 
 
 
290 aa  210  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
286 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  37.76 
 
 
287 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.02 
 
 
295 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
290 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
302 aa  208  8e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
286 aa  208  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.31 
 
 
287 aa  208  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.86 
 
 
286 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.01 
 
 
286 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.01 
 
 
286 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  38.41 
 
 
289 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1026  ATP synthase F1, gamma subunit  36.86 
 
 
295 aa  208  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.59 
 
 
287 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.94 
 
 
292 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>