More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2182 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  60.19 
 
 		 149 aa  127  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 104 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  120  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  53.4 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  51.46 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  113  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  48.04 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  47.57 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  52.48 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>