More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2181 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 88 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  82.95 
 
 		 89 aa  150  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2249  50S ribosomal protein L27  79.55 
 
 		 89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  78.16 
 
 		 89 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2057  50S ribosomal protein L27  78.16 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  78.16 
 
 		 88 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  74.42 
 
 		 88 aa  127  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  84.29 
 
 		 83 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  76.06 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 87 aa  106  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000924332  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4327  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  75.71 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  67.61 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  67.61 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  63.74 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  62.79 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  59.09 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  71.43 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  59.09 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>