More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2175 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 96 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  81.05 
 
 		 96 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  76.84 
 
 		 95 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 		 95 aa  147  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 		 95 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 		 96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 		 96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 		 95 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 95 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 95 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 97 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 97 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 97 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  67.74 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 95 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  63.54 
 
 		 96 aa  127  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 95 aa  126  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 94 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 95 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 104 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 105 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 105 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 96 aa  123  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 95 aa  123  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  123  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  123  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  60.42 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  61.29 
 
 		 98 aa  121  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  59.57 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 98 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 97 aa  120  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  120  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  121  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 104 aa  120  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 97 aa  120  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 97 aa  120  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 97 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 98 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>