More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2163 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  69.2 
 
 		 263 aa  341  8e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  58.17 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  54.92 
 
 		 267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  54.92 
 
 		 264 aa  298  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 265 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  54.75 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  53.99 
 
 		 265 aa  292  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  52.47 
 
 		 262 aa  285  5e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  53.82 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  54.75 
 
 		 265 aa  278  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  52.47 
 
 		 264 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  51.33 
 
 		 264 aa  278  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  51.33 
 
 		 264 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  52.47 
 
 		 264 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  47.53 
 
 		 265 aa  275  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 		 260 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  52.63 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  46.77 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 		 265 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  50.95 
 
 		 264 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  53.61 
 
 		 264 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  51.19 
 
 		 270 aa  271  9e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  50.57 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  51.61 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  51.33 
 
 		 264 aa  268  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  52.09 
 
 		 264 aa  268  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  50.19 
 
 		 264 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  51.33 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  50.57 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  50.19 
 
 		 264 aa  265  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 		 264 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  52.96 
 
 		 264 aa  265  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  50.19 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  50.19 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  50 
 
 		 282 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  50.19 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  50.19 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 		 264 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  52.47 
 
 		 264 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  50.19 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  50.99 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  49.43 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  49.05 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  49.43 
 
 		 264 aa  258  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  49.8 
 
 		 265 aa  258  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  47.91 
 
 		 264 aa  255  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  50.2 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  47.64 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 267 aa  251  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  49.43 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  46.01 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  47.35 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  46.01 
 
 		 264 aa  242  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  46.01 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  51.71 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  52.51 
 
 		 261 aa  239  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 		 245 aa  235  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  46.77 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  53.91 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  46.99 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.16 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  43.15 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.39 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  42.46 
 
 		 251 aa  211  9e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  40 
 
 		 242 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  36.02 
 
 		 357 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  35.93 
 
 		 342 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  33.04 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  36.02 
 
 		 663 aa  125  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3388  ABC transporter related  35.71 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  33.47 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  35.19 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  32.93 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  32.93 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  32.31 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0787  ABC transporter related  33.91 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 		 353 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  35.27 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  35.27 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  35.27 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.64 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  36.74 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  30.74 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.97 
 
 		 668 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  35.5 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.48 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.07 
 
 		 382 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>