135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2161 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  100 
 
 		 324 aa  656    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  62.46 
 
 		 320 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  46.69 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  43.96 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  46.13 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  44.14 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  45.72 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  44.26 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  44.26 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  47.37 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.98 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  46.31 
 
 		 321 aa  268  8.999999999999999e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  42.86 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  45.36 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  40.49 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  44.97 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  43.51 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  43.23 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  44.08 
 
 		 323 aa  248  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  43.58 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  44.34 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  45.18 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  41.42 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  40.85 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  40.74 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  39.33 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  42.81 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  42.47 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  42.47 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  43.43 
 
 		 344 aa  235  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  41.42 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.44 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.44 
 
 		 323 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.44 
 
 		 323 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.44 
 
 		 323 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.44 
 
 		 323 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  40.13 
 
 		 323 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  40.13 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  40.13 
 
 		 323 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  40.26 
 
 		 337 aa  225  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  42.76 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  40.73 
 
 		 326 aa  225  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.78 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  40.4 
 
 		 326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  39.8 
 
 		 329 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  41.78 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  41.18 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  40.27 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  42.18 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  39.93 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  39.93 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  39.93 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  43.3 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  40.13 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  38.68 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  38.94 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  36.12 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  38.18 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  38.33 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  36.6 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  44.08 
 
 		 270 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  37.79 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  38.13 
 
 		 370 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  37.7 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  39.26 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.12 
 
 		 584 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  34.92 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  33.23 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.92 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  33.56 
 
 		 338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  31.79 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.96 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  31.31 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  31.69 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  30.03 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  32.81 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  29.82 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  32.66 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  32.01 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  28.72 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  29.68 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  28.92 
 
 		 359 aa  142  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  32.89 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.3 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  27.38 
 
 		 344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  29.55 
 
 		 640 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.1 
 
 		 352 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  30.88 
 
 		 384 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  26.1 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  26.56 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  21.45 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  26.53 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.19 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  24.31 
 
 		 331 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  25.35 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  28.28 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  26.48 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  24.48 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  28.81 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  25.69 
 
 		 320 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>