More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2159 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 422 aa  857    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  55.58 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  55.1 
 
 		 443 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  55.94 
 
 		 429 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  56.12 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  54.82 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  47.7 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  49.09 
 
 		 455 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  49.05 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.91 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  50.24 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  48.15 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  48.2 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  46.35 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  46.12 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  46.95 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  47.37 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  47.37 
 
 		 428 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  51.54 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  50 
 
 		 445 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  51.03 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  48.37 
 
 		 439 aa  362  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  51.03 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  49.74 
 
 		 439 aa  359  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  48.37 
 
 		 438 aa  359  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  47.99 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  50.77 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  48.22 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  47.97 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  47.86 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  44.39 
 
 		 441 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  49.37 
 
 		 445 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  44.37 
 
 		 461 aa  354  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  44.52 
 
 		 445 aa  345  8e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  44.52 
 
 		 445 aa  345  8e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  46.68 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  45.98 
 
 		 468 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  45.18 
 
 		 439 aa  342  8e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  45.91 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  45.95 
 
 		 455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  47.59 
 
 		 480 aa  332  7.000000000000001e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  49.85 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  47.63 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  42.06 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 		 446 aa  329  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  46.36 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  46.36 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  46.58 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  44.04 
 
 		 456 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  50.29 
 
 		 423 aa  325  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  48.23 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  49.71 
 
 		 451 aa  322  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  43.17 
 
 		 458 aa  322  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  46.32 
 
 		 446 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  45.24 
 
 		 426 aa  322  8e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  45.73 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  43.67 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  42.73 
 
 		 445 aa  320  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  46.2 
 
 		 445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  41.42 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  41.81 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  48.08 
 
 		 410 aa  319  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  43.42 
 
 		 445 aa  318  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  48.83 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  45.09 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  42.89 
 
 		 462 aa  316  5e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  46.59 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  46.59 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  42.13 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 		 448 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  43.9 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  41.86 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  40 
 
 		 419 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  48.4 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  47.28 
 
 		 447 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  41.49 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  47.81 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  45.23 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  45.78 
 
 		 440 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  45.94 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  48.21 
 
 		 456 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  45.78 
 
 		 449 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  48.1 
 
 		 452 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  44.42 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  44.92 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  43.46 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  44.42 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  40.79 
 
 		 478 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  48.51 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  45.09 
 
 		 459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  44.5 
 
 		 437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  44.5 
 
 		 444 aa  306  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  44.61 
 
 		 530 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  44.61 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  44.11 
 
 		 521 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  44.61 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  44.61 
 
 		 530 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>