More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2152 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  78.93 
 
 		 242 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  77.27 
 
 		 242 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  75.62 
 
 		 242 aa  394  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  67.08 
 
 		 242 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  66.67 
 
 		 249 aa  342  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  68.6 
 
 		 244 aa  341  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  65.56 
 
 		 249 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  66.39 
 
 		 243 aa  337  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  65.56 
 
 		 243 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  64.44 
 
 		 249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  65.56 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  64.73 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  65.15 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  64.02 
 
 		 258 aa  331  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  64.02 
 
 		 267 aa  330  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.08 
 
 		 242 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  61.57 
 
 		 244 aa  328  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  65.25 
 
 		 246 aa  328  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  61 
 
 		 259 aa  327  7e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 240 aa  325  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  61.51 
 
 		 247 aa  324  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 		 269 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 		 251 aa  323  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  62.5 
 
 		 243 aa  323  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  62.08 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  61.92 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  63.33 
 
 		 255 aa  322  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  62.5 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  61.92 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  63.18 
 
 		 268 aa  322  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  62.92 
 
 		 246 aa  322  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  61.09 
 
 		 269 aa  322  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  61.83 
 
 		 246 aa  322  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  62.81 
 
 		 242 aa  322  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  61.51 
 
 		 257 aa  321  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  62.76 
 
 		 273 aa  321  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  61.92 
 
 		 263 aa  321  7e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  60.83 
 
 		 253 aa  321  7e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.67 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  60.67 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  60.67 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  62.08 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  61.09 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  61.51 
 
 		 257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  61.83 
 
 		 257 aa  319  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  62.76 
 
 		 273 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  61.92 
 
 		 263 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  61.25 
 
 		 249 aa  319  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  62.92 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 262 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  60 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  62.71 
 
 		 259 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 		 252 aa  318  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60.42 
 
 		 252 aa  318  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  61.25 
 
 		 243 aa  318  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  59.34 
 
 		 246 aa  317  7.999999999999999e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 242 aa  317  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  61.51 
 
 		 258 aa  317  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  62.08 
 
 		 243 aa  317  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 		 245 aa  317  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.41 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  61.51 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 		 252 aa  315  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  59.75 
 
 		 247 aa  315  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 		 252 aa  315  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.51 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  60.42 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  61.25 
 
 		 267 aa  315  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  59.75 
 
 		 254 aa  315  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  58.92 
 
 		 252 aa  314  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  58.92 
 
 		 252 aa  314  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  58.92 
 
 		 252 aa  314  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  58.92 
 
 		 252 aa  314  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 		 252 aa  314  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.17 
 
 		 253 aa  314  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  60.83 
 
 		 247 aa  314  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  61.67 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  60 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  58.92 
 
 		 255 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.58 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.34 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  61.67 
 
 		 245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  62.55 
 
 		 243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  59.34 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  60 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  61.41 
 
 		 266 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 		 270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  60.58 
 
 		 252 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  64.17 
 
 		 252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  61.67 
 
 		 246 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.25 
 
 		 246 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  60.42 
 
 		 246 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  61 
 
 		 258 aa  311  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  58.75 
 
 		 253 aa  311  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  58.75 
 
 		 253 aa  311  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>