More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2149 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  508  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  57.55 
 
 
250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  52 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  51 
 
 
255 aa  260  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  50.2 
 
 
299 aa  260  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  49 
 
 
276 aa  260  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  51.81 
 
 
250 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  49.6 
 
 
256 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  49.8 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  44.18 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  46.18 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  43.03 
 
 
252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  47.39 
 
 
250 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  44.62 
 
 
253 aa  237  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  44.22 
 
 
253 aa  236  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  43.82 
 
 
260 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  46.94 
 
 
259 aa  231  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  42.57 
 
 
252 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  41.5 
 
 
258 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 
272 aa  216  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  41.5 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  39.92 
 
 
252 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  41.5 
 
 
261 aa  208  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  42.68 
 
 
254 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  39.76 
 
 
262 aa  205  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  37.01 
 
 
262 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.65 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.6 
 
 
274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  38.75 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  43.56 
 
 
274 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  38.98 
 
 
258 aa  192  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  41.39 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
255 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  40.98 
 
 
258 aa  184  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  40.32 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36.9 
 
 
257 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  40 
 
 
259 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  37.71 
 
 
254 aa  176  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.75 
 
 
269 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  37.7 
 
 
249 aa  174  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.95 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1603  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.86 
 
 
258 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1788  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.86 
 
 
258 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.193205  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  32.94 
 
 
256 aa  168  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  37.35 
 
 
268 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  34.24 
 
 
258 aa  168  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1908  ABC transporter related  43.59 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  39.68 
 
 
414 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.13 
 
 
536 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  38.74 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  38.84 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  38.37 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1970  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.86 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  38.25 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
275 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  38.24 
 
 
262 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.3 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  35.43 
 
 
409 aa  162  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  38.46 
 
 
455 aa  161  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  39.29 
 
 
424 aa  161  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  37.85 
 
 
253 aa  161  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  31.62 
 
 
265 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  39.68 
 
 
261 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  39.68 
 
 
261 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  39.68 
 
 
261 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  32.95 
 
 
418 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  34.78 
 
 
272 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  40.08 
 
 
278 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0814  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
260 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.75 
 
 
259 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 
272 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  38.34 
 
 
384 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  36.19 
 
 
269 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3868  ABC transporter related protein  40 
 
 
270 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282288  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 
267 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  37.8 
 
 
274 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  42.29 
 
 
267 aa  159  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 
265 aa  158  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 
269 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  35.71 
 
 
269 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  35.95 
 
 
253 aa  158  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 
264 aa  158  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.33 
 
 
257 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  36.68 
 
 
266 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
263 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  40.73 
 
 
271 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 
272 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 
272 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  35.92 
 
 
268 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 
272 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 
272 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  36.11 
 
 
263 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  34.14 
 
 
254 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 
272 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 
272 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  35.32 
 
 
269 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  35.37 
 
 
253 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>