More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2117 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 391 aa  759    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  49.87 
 
 		 386 aa  353  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  48.54 
 
 		 383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  49.86 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 405 aa  252  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 411 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 420 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 404 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  28.07 
 
 		 409 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.24 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 393 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  23.12 
 
 		 432 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  23.48 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  23.55 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  23.48 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  23.48 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  26.9 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  26.9 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 393 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.66 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  25.4 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 474 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  26.9 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  30.43 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.37 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.37 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  25.38 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1602  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.822516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5357  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  36.6 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.52 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  34.52 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.65 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  33.93 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.93 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.93 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.93 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.93 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.93 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  24.7 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.18 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  24.65 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.73 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.22 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.64 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.68 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.47 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.87 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.62 
 
 		 529 aa  73.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.72 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.13 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>