44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2089 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  100 
 
 
101 aa  206  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  48.84 
 
 
92 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  48.84 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  47.56 
 
 
87 aa  87  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  43.82 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  41.77 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  39.02 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  39.02 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  41.98 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  50.98 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  39.76 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  47.37 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  38.96 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  44.87 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  44 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  38.57 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  43.59 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  43.33 
 
 
79 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1980  FoF1 ATP synthase, subunit I  45 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0599038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  36.76 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2386  hypothetical protein  35.06 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0414094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  36.49 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0189  hypothetical protein  44.12 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  44.19 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0766  ATP synthase F0, subunit I  35.82 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  37.68 
 
 
145 aa  47  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  47.17 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2700  FoF1 ATP synthase, subunit I  41.79 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571975  normal  0.0892291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1039  FoF1 ATP synthase, subunit I  41.79 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  39.39 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2880  hypothetical protein  36.92 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737806  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  31.08 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  31.08 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0270  FoF1 ATP synthase, subunit I  36.23 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  27.5 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  32.35 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  32.86 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0446  putative FOF1 ATP synthase, subunit I transmembrane protein  35.38 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912309  normal  0.120038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  38.89 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3031  ATP synthase F0  38.18 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.285856 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  28.75 
 
 
115 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  44.44 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0239  FoF1 ATP synthase, subunit I  30.43 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0695  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>