More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2084 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  100 
 
 		 74 aa  156  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  72.06 
 
 		 69 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1442  50S ribosomal protein L31  71.83 
 
 		 71 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  68.66 
 
 		 71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  70.59 
 
 		 70 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 69 aa  102  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  62.16 
 
 		 73 aa  93.6  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  52.78 
 
 		 73 aa  90.5  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  54.79 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 67 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  53.73 
 
 		 70 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  53.12 
 
 		 68 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 73 aa  87  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  52.31 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 67 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 67 aa  86.7  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 72 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  49.3 
 
 		 71 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  58.46 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  54.93 
 
 		 72 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 65 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 68 aa  84.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  46.48 
 
 		 71 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  52.78 
 
 		 72 aa  84  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  50.75 
 
 		 70 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  47.3 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  47.3 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  47.22 
 
 		 100 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 68 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  45.07 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  56.72 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 65 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  47.22 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  51.39 
 
 		 72 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  54.41 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3811  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4788  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000702878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0118  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4098  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  52.17 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  45.07 
 
 		 71 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  59.02 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  54.67 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  53.85 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 71 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  47.89 
 
 		 71 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  47.89 
 
 		 71 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 68 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 68 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 66 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>