More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2075 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  65.81 
 
 		 235 aa  339  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  69.66 
 
 		 235 aa  332  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0442  50S ribosomal protein L1  70.09 
 
 		 235 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  65.8 
 
 		 234 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  64.53 
 
 		 235 aa  322  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  61.37 
 
 		 234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  61.3 
 
 		 234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  61.3 
 
 		 234 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  61.57 
 
 		 233 aa  298  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 233 aa  297  9e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  62.39 
 
 		 231 aa  295  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  59.66 
 
 		 233 aa  295  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  60.7 
 
 		 233 aa  292  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  60.26 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  57.83 
 
 		 233 aa  284  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 235 aa  281  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 232 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  57.59 
 
 		 231 aa  278  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  61.14 
 
 		 232 aa  271  6e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 235 aa  267  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  55.86 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  55.81 
 
 		 234 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  55.35 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  55.35 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 233 aa  264  7e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  56.31 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  262  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  262  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  52.14 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  55.35 
 
 		 234 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  53.02 
 
 		 236 aa  261  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  55.66 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  51.75 
 
 		 235 aa  258  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  55.36 
 
 		 233 aa  258  6e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  51.48 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  52.59 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 232 aa  255  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 232 aa  254  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  52.59 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  52.94 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  50 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 232 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  52.86 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  52.19 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  51.97 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 233 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  53.51 
 
 		 232 aa  248  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  56.5 
 
 		 231 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  247  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 235 aa  247  9e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  49.57 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 233 aa  245  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  50 
 
 		 238 aa  245  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  47.81 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 232 aa  244  8e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  48.7 
 
 		 233 aa  244  9e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0837  50S ribosomal protein L1P  55.07 
 
 		 229 aa  244  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0423664  normal  0.0981496 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  48.93 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  50.85 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  47.83 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  52.49 
 
 		 229 aa  241  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  54.04 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  50.92 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>