More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2067 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2080  translation elongation factor Tu  100 
 
 
398 aa  798  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.690947  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  82.91 
 
 
397 aa  672  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1628  elongation factor Tu  84.67 
 
 
397 aa  644  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2067  translation elongation factor Tu  100 
 
 
398 aa  798  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  4.42847e-11  normal  0.246821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0447  elongation factor Tu  85.68 
 
 
397 aa  665  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  77.39 
 
 
396 aa  638  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  77.39 
 
 
396 aa  638  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2989  elongation factor Tu  83.67 
 
 
397 aa  649  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1447  elongation factor Tu  84.92 
 
 
397 aa  660  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  81.66 
 
 
397 aa  665  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  76.69 
 
 
396 aa  636  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  77.39 
 
 
396 aa  638  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  77.39 
 
 
396 aa  638  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  76.19 
 
 
396 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  76.19 
 
 
396 aa  630  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  76.63 
 
 
397 aa  634  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.07786e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  76.63 
 
 
397 aa  634  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0695  elongation factor Tu  79.4 
 
 
397 aa  628  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000151586  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0706  elongation factor Tu  79.4 
 
 
397 aa  628  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  2.40692e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  77.44 
 
 
396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  628  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  76.44 
 
 
396 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  76.44 
 
 
396 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  77.86 
 
 
399 aa  629  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.95422e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0686  elongation factor Tu  77.61 
 
 
399 aa  629  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  77.44 
 
 
396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  75.94 
 
 
396 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  76.44 
 
 
396 aa  624  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  76.69 
 
 
396 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  626  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  76.19 
 
 
396 aa  624  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  76.19 
 
 
396 aa  624  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  76.44 
 
 
396 aa  624  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  76.69 
 
 
396 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  75.94 
 
 
396 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  76.69 
 
 
396 aa  621  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  76.94 
 
 
396 aa  623  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  74.81 
 
 
400 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.57985e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  74.87 
 
 
396 aa  623  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1541  elongation factor Tu  78.64 
 
 
397 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.161942  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  76.19 
 
 
395 aa  617  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1553  elongation factor Tu  78.64 
 
 
397 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000482346  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  76.06 
 
 
396 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  76.06 
 
 
396 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  77.08 
 
 
396 aa  620  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  77.39 
 
 
396 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  73.87 
 
 
397 aa  615  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.83253e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  75.63 
 
 
396 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  77.39 
 
 
396 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  75.63 
 
 
396 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  73.93 
 
 
396 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  73.87 
 
 
397 aa  615  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.81174e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  73.93 
 
 
396 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  7.97106e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  611  1e-174  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  1.51481e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  78.89 
 
 
396 aa  611  1e-174  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  611  1e-174  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  78.89 
 
 
396 aa  611  1e-174  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  73.93 
 
 
397 aa  607  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  73.93 
 
 
397 aa  607  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  72.75 
 
 
399 aa  608  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  2.85931e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1344  elongation factor Tu  77.94 
 
 
396 aa  605  1e-172  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.536684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  73.25 
 
 
397 aa  607  1e-172  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.34885e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  73.25 
 
 
397 aa  607  1e-172  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  73.25 
 
 
397 aa  607  1e-172  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  8.16391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  74.5 
 
 
397 aa  605  1e-172  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  77.69 
 
 
396 aa  606  1e-172  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  77.69 
 
 
396 aa  606  1e-172  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  73.25 
 
 
397 aa  607  1e-172  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.67982e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1331  elongation factor Tu  77.94 
 
 
396 aa  605  1e-172  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0012019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3330  elongation factor Tu  78.39 
 
 
396 aa  605  1e-172  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91579e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  73.43 
 
 
396 aa  606  1e-172  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0311  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  605  1e-172  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3343  elongation factor Tu  78.39 
 
 
396 aa  605  1e-172  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0582  elongation factor Tu  77.44 
 
 
396 aa  605  1e-172  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0325  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  605  1e-172  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.275223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0495  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  605  1e-172  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0610373  hitchhiker  7.94033e-09 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0918  elongation factor Tu  78.39 
 
 
396 aa  605  1e-172  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0483  elongation factor Tu  75.44 
 
 
396 aa  605  1e-172  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  9.18892e-06  hitchhiker  2.59901e-06 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  73.43 
 
 
396 aa  606  1e-172  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  74.19 
 
 
400 aa  603  1e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  73.82 
 
 
400 aa  603  1e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  73.82 
 
 
400 aa  603  1e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.99 
 
 
394 aa  602  1e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.02802e-06  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.99 
 
 
394 aa  602  1e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.14684e-06  hitchhiker  3.34083e-08 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  74.12 
 
 
391 aa  601  1e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  77.94 
 
 
396 aa  603  1e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  73.82 
 
 
400 aa  602  1e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  74.12 
 
 
391 aa  601  1e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  72.75 
 
 
397 aa  603  1e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  73.5 
 
 
396 aa  604  1e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  7.05932e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  73.68 
 
 
395 aa  602  1e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.52961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  73.5 
 
 
396 aa  603  1e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  73.82 
 
 
400 aa  601  1e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.94067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  72 
 
 
399 aa  603  1e-171  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  71.61 
 
 
394 aa  602  1e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  7.67064e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1948  elongation factor Tu  77.44 
 
 
396 aa  602  1e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  73.99 
 
 
394 aa  603  1e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.01579e-08  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  76.19 
 
 
396 aa  601  1e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  73.99 
 
 
394 aa  603  1e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.49049e-06  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  77.94 
 
 
396 aa  603  1e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>