More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2066 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
105 aa  214  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  1.45478e-12  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  89.52 
 
 
105 aa  196  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1766  30S ribosomal protein S10  88.57 
 
 
105 aa  195  2e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  5.57802e-06  normal  0.938375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2258  30S ribosomal protein S10  88.57 
 
 
105 aa  195  2e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  3.23057e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2775  30S ribosomal protein S10  91.18 
 
 
102 aa  193  5e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0390875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0659  30S ribosomal protein S10  87.62 
 
 
105 aa  193  5e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.22107e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
103 aa  157  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  6.33059e-05  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  154  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 
123 aa  154  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  8.99576e-06 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  154  5e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  154  5e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  154  5e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  154  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.05972e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89761e-15 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  4.49756e-05 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  151  3e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  151  3e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  151  3e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  150  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  150  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  150  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.58853e-05  hitchhiker  3.28358e-14 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  150  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  150  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  149  9e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 
102 aa  149  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  70.3 
 
 
102 aa  149  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  69.61 
 
 
102 aa  149  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.32715e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  69.61 
 
 
102 aa  149  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  5.81864e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  71.57 
 
 
101 aa  147  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0305  ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  146  8e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.33988  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
103 aa  146  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 
102 aa  145  1e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1354  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
103 aa  145  1e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.546745  normal  0.0408576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
102 aa  145  2e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
103 aa  145  2e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  1.33875e-06  hitchhiker  7.22255e-07 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  145  2e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
102 aa  145  2e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  4.86821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
103 aa  145  2e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  2.31204e-05  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  68.63 
 
 
104 aa  144  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  144  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  63.46 
 
 
108 aa  144  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
104 aa  144  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  67.65 
 
 
103 aa  144  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.64723e-06  decreased coverage  9.47215e-06 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  3.57931e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  2.33009e-11  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
103 aa  143  8e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  4.83294e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.6598e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  1.3045e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  143  8e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.38297e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  4.24797e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.27153e-08  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
103 aa  143  8e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  7.05562e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  4.75308e-10  hitchhiker  1.62231e-11 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
103 aa  143  8e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  1.56586e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.22515e-09  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  3.12385e-05  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
103 aa  143  8e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  1.27009e-05  decreased coverage  9.26134e-10 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  5.13436e-06  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  8e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  9.98747e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  143  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  1.49229e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
104 aa  143  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  4.4729e-05  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0326  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0169409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
103 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.8248e-09  unclonable  9.40306e-08 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0496  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.250229  hitchhiker  4.05496e-09 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
103 aa  141  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  1.8475e-05  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  141  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
103 aa  140  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.41431e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3339  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
103 aa  140  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  1.04246e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0227  ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  140  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
103 aa  140  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>