More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2055 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  245  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  81.15 
 
 		 122 aa  207  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 		 122 aa  202  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  198  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  196  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  192  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  192  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  75.41 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  190  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  76.23 
 
 		 122 aa  189  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  189  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  189  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  75.63 
 
 		 119 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2808  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  75.63 
 
 		 119 aa  187  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  75.63 
 
 		 119 aa  187  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  73.98 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  186  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  186  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  72.95 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  185  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  185  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0209  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000783704  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4046  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000176442  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0241  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4160  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000182968  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0210  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000995848  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0333  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  183  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0206  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025278  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0209  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278183  unclonable  0.0000000000139083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0204  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000238487  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3749  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000123635  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0223  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000101155  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000686211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3939  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0180  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3432  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0231126  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2314  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000028271  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0158  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000251869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0848  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1936  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0485  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000117206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0330  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000152451  hitchhiker  0.00105962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2159  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  0.234702 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>