More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2026 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  100 
 
 
493 aa  989  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  2.41588e-10  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  69.14 
 
 
492 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.77 
 
 
512 aa  588  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  64.25 
 
 
518 aa  582  1e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  63.72 
 
 
508 aa  572  1e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  60.33 
 
 
512 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  58.24 
 
 
451 aa  528  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.52662e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  58.51 
 
 
443 aa  525  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.55 
 
 
452 aa  516  1e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.07321e-08  hitchhiker  1.41752e-06 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  56.83 
 
 
452 aa  506  1e-142  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  57.77 
 
 
449 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.57828e-07  unclonable  2.8199e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  56.52 
 
 
449 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  3.80679e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  57.31 
 
 
449 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.08298e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  57.54 
 
 
449 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.32061e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  57.54 
 
 
449 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16729e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  57.31 
 
 
449 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.61017e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  57.54 
 
 
449 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.28008e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  57.54 
 
 
449 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  57.54 
 
 
449 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  3.47799e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  57.77 
 
 
449 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  57.77 
 
 
449 aa  503  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.6406e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  56.64 
 
 
446 aa  498  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  8.59311e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  58.25 
 
 
469 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  57.08 
 
 
449 aa  495  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.43009e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  56.64 
 
 
446 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  6.90531e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  50.62 
 
 
479 aa  493  1e-138  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  56.64 
 
 
448 aa  492  1e-138  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  56.74 
 
 
453 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.77324e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  57.24 
 
 
454 aa  490  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.93458e-05  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  57.24 
 
 
454 aa  490  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  55.58 
 
 
453 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  9.44997e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  55.38 
 
 
463 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.52943e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  57.24 
 
 
446 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.40128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  56.38 
 
 
453 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  3.27935e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  55.92 
 
 
453 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.4 
 
 
447 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.70112e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.98 
 
 
447 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.8858e-09  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  53.15 
 
 
455 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.99025e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  53.85 
 
 
449 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  52.49 
 
 
445 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.88375e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  54.29 
 
 
444 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  53.15 
 
 
455 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  4.65855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  53.61 
 
 
455 aa  478  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  7.9449e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.05 
 
 
446 aa  467  1e-130  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.41723e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  56.64 
 
 
452 aa  468  1e-130  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  2.16081e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  53.02 
 
 
433 aa  463  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.21808e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  53.21 
 
 
444 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  53.15 
 
 
443 aa  463  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.09658e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  53.02 
 
 
433 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  53.67 
 
 
444 aa  461  1e-128  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.14 
 
 
481 aa  459  1e-128  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  4.91114e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  53.27 
 
 
443 aa  456  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  54.39 
 
 
448 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.38232e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  51.11 
 
 
449 aa  452  1e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.64274e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  52.49 
 
 
485 aa  452  1e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  50.9 
 
 
450 aa  454  1e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  48.84 
 
 
521 aa  452  1e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  53.55 
 
 
457 aa  454  1e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  52.17 
 
 
458 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  48.95 
 
 
520 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  51.75 
 
 
441 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  53.81 
 
 
452 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.61061e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  53.81 
 
 
452 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  2.99479e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  52.17 
 
 
458 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  52.74 
 
 
445 aa  451  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  9.11633e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  51.86 
 
 
444 aa  448  1e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  50.68 
 
 
454 aa  447  1e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.25745e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  51.5 
 
 
450 aa  447  1e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.92246e-06  unclonable  2.76763e-08 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  52.35 
 
 
457 aa  447  1e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  4.9947e-07  hitchhiker  7.52283e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  53.33 
 
 
457 aa  445  1e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.96553e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  51.76 
 
 
492 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  50.34 
 
 
450 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  52.41 
 
 
453 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  52.41 
 
 
453 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  52.41 
 
 
453 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  51.71 
 
 
457 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.42448e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  51.72 
 
 
459 aa  443  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  51.17 
 
 
444 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.95764e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  51.76 
 
 
492 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  51.49 
 
 
463 aa  441  1e-122  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  50 
 
 
439 aa  439  1e-122  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  53.08 
 
 
457 aa  441  1e-122  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  1.42989e-05  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  47.28 
 
 
446 aa  441  1e-122  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.18 
 
 
462 aa  440  1e-122  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  51.38 
 
 
436 aa  439  1e-122  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.6303e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  49 
 
 
476 aa  436  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.13263e-10  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  50.59 
 
 
435 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.2194e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.76 
 
 
443 aa  435  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50 
 
 
490 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.66323e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  49.2 
 
 
441 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  51.49 
 
 
458 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  52.9 
 
 
457 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.77 
 
 
491 aa  432  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.1 
 
 
447 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  50.43 
 
 
453 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  51.26 
 
 
478 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  51.64 
 
 
453 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0851  signal recognition particle protein  52.82 
 
 
453 aa  435  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.29048e-05  hitchhiker  2.34744e-05 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  48.82 
 
 
456 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  51.88 
 
 
453 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>