More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1996 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  59.08 
 
 
577 aa  696  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  60.18 
 
 
573 aa  721  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  100 
 
 
567 aa  1165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  62.61 
 
 
568 aa  748  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.92 
 
 
553 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  44.14 
 
 
558 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  44.97 
 
 
871 aa  490  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.17 
 
 
553 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  44.68 
 
 
571 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  42.73 
 
 
571 aa  472  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  41.77 
 
 
787 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.14 
 
 
563 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  42.7 
 
 
558 aa  469  1e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.04 
 
 
568 aa  471  1e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  41.56 
 
 
564 aa  470  1e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  44.33 
 
 
561 aa  471  1e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  43.37 
 
 
568 aa  467  1e-130  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.88 
 
 
568 aa  465  1e-130  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
553 aa  468  1e-130  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  43.85 
 
 
554 aa  463  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.19 
 
 
553 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.27 
 
 
571 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  44.52 
 
 
559 aa  464  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.48 
 
 
557 aa  461  1e-128  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.74 
 
 
568 aa  459  1e-128  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.74 
 
 
568 aa  459  1e-128  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.59 
 
 
566 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  42.5 
 
 
558 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
556 aa  455  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  43.74 
 
 
561 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.71 
 
 
568 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  41.42 
 
 
573 aa  458  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  43.36 
 
 
599 aa  455  1e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  43.52 
 
 
610 aa  454  1e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  41.95 
 
 
555 aa  454  1e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  43.18 
 
 
599 aa  454  1e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.23 
 
 
568 aa  455  1e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  40.96 
 
 
557 aa  453  1e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  43.01 
 
 
599 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  42.31 
 
 
603 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.58 
 
 
570 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.26903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  41.62 
 
 
561 aa  447  1e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  42.96 
 
 
564 aa  447  1e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.81 
 
 
568 aa  446  1e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.92 
 
 
568 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.92 
 
 
568 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  42.46 
 
 
561 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.02 
 
 
568 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  41 
 
 
572 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.17 
 
 
568 aa  439  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.21 
 
 
563 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.58 
 
 
520 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  40.73 
 
 
589 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  41.68 
 
 
885 aa  431  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  44.44 
 
 
520 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.01 
 
 
514 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.08 
 
 
571 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.51 
 
 
570 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  39.11 
 
 
561 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  41.02 
 
 
586 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  41.02 
 
 
586 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  41.4 
 
 
577 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  41.2 
 
 
586 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  39.93 
 
 
585 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  40.56 
 
 
571 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.12 
 
 
577 aa  419  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  37.72 
 
 
563 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  40.11 
 
 
586 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  40 
 
 
570 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.87 
 
 
570 aa  422  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  41.61 
 
 
586 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  40.46 
 
 
584 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  44.99 
 
 
521 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  41.15 
 
 
586 aa  416  1e-115  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  40.97 
 
 
586 aa  416  1e-115  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  39.86 
 
 
591 aa  417  1e-115  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  40.7 
 
 
586 aa  417  1e-115  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  41.15 
 
 
586 aa  416  1e-115  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  41.15 
 
 
586 aa  416  1e-115  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  40.49 
 
 
587 aa  418  1e-115  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  37.39 
 
 
562 aa  418  1e-115  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  39.06 
 
 
576 aa  413  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  6.42239e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  39.65 
 
 
637 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  40.73 
 
 
586 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  40.25 
 
 
688 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
888 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  38.42 
 
 
612 aa  415  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  40.07 
 
 
582 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  40.07 
 
 
577 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  41.48 
 
 
573 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  38.17 
 
 
552 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  39.72 
 
 
585 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  37.19 
 
 
565 aa  406  1e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  37.57 
 
 
560 aa  407  1e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  42.39 
 
 
550 aa  407  1e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  39.72 
 
 
568 aa  406  1e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  39.33 
 
 
594 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  36.74 
 
 
561 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  40.88 
 
 
574 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  38.91 
 
 
570 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>