53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1967 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  100 
 
 		 167 aa  345  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  79.64 
 
 		 167 aa  286  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  77.84 
 
 		 167 aa  277  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  82.24 
 
 		 162 aa  268  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  80.39 
 
 		 162 aa  261  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  80.26 
 
 		 162 aa  257  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  66.19 
 
 		 140 aa  193  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  63.95 
 
 		 147 aa  191  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  65.47 
 
 		 140 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  63.51 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  66.19 
 
 		 161 aa  187  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  64.03 
 
 		 140 aa  187  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  64.66 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  61.64 
 
 		 146 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  60.81 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  67.52 
 
 		 145 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  50 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  45.99 
 
 		 159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  45.65 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.78 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  45.32 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.67 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.05 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.96 
 
 		 114 aa  84.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.64 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  30.09 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.39 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 103 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 642 aa  50.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.99 
 
 		 105 aa  50.8  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  37.29 
 
 		 610 aa  44.7  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3883  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.1 
 
 		 84 aa  44.3  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.98 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.71 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.969084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 81 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.98 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 658 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2420  ferredoxin family protein  36.51 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.498162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 		 672 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 81 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.88 
 
 		 90 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 81 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323948  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7631  ferredoxin  38.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.3 
 
 		 1126 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 81 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.51 
 
 		 88 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  35.59 
 
 		 602 aa  41.2  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  40.32 
 
 		 60 aa  40.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.79 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1265  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 58 aa  41.2  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.755601  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1709  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 658 aa  40.8  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4190  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.24 
 
 		 77 aa  40.8  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.806772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>