183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1963 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  100 
 
 
407 aa  835    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  64.79 
 
 
408 aa  541  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  61.22 
 
 
384 aa  502  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  60.97 
 
 
384 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  60.71 
 
 
384 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  56.89 
 
 
393 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  41.2 
 
 
398 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  38.08 
 
 
391 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  38.24 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  38.9 
 
 
392 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.24 
 
 
382 aa  149  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.85 
 
 
385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.33 
 
 
367 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  39.6 
 
 
194 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  37.5 
 
 
129 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4212  putative citrate utilization protein B (citB)  24.53 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  35.11 
 
 
194 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.58 
 
 
193 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  26.61 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  37.36 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  25.69 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  34.21 
 
 
148 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.68 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  31.63 
 
 
188 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  31.78 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.79 
 
 
189 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0793  CitB domain-containing protein  25.23 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  36.84 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  37.17 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  35.05 
 
 
193 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3134  CitB domain protein  24.43 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.870392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.65 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  35.48 
 
 
186 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  36.25 
 
 
156 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.58 
 
 
192 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.33 
 
 
187 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.47 
 
 
192 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.91 
 
 
192 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  32.69 
 
 
192 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  27.47 
 
 
216 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  24.48 
 
 
189 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.47 
 
 
192 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.67 
 
 
133 aa  64.3  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.36 
 
 
193 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  25.23 
 
 
404 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.26 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  24.14 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  34.41 
 
 
186 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.22 
 
 
174 aa  62.8  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.71 
 
 
184 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  36.63 
 
 
253 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  34.34 
 
 
204 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  35.71 
 
 
184 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  35.71 
 
 
184 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  26.37 
 
 
194 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8555  CitB domain protein  23.58 
 
 
398 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.388597  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  26.37 
 
 
194 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.71 
 
 
193 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  25.27 
 
 
182 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  28.43 
 
 
238 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2723  CitB domain-containing protein  25.36 
 
 
372 aa  60.1  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  25.24 
 
 
184 aa  60.1  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.34 
 
 
184 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  33.71 
 
 
195 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  30.34 
 
 
238 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  25.27 
 
 
194 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2087  CitB domain-containing protein  31.65 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0934488  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  29.52 
 
 
185 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2503  putative ferredoxin  24.85 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  29.03 
 
 
213 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3814  CitB domain-containing protein  25.39 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  33.73 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6302  CitB domain-containing protein  22.78 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  29.89 
 
 
502 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3489  citrate utilization protein B  25.99 
 
 
388 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57381  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1125  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.03 
 
 
499 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  29.03 
 
 
213 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.31 
 
 
200 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  28.43 
 
 
202 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.53 
 
 
196 aa  57  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  34.21 
 
 
204 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.91 
 
 
188 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  30.7 
 
 
502 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  27.78 
 
 
202 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2275  CitB domain-containing protein  25 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  24.53 
 
 
239 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.03 
 
 
160 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0931  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  30.28 
 
 
478 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.53 
 
 
437 aa  53.9  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  39.39 
 
 
423 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  30.1 
 
 
246 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.61 
 
 
203 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.14 
 
 
699 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2518  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.46 
 
 
461 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  30.3 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.29 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0688  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.36 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>