56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1935 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 375 aa  776    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  65.38 
 
 		 368 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  39.34 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  41.74 
 
 		 371 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  32.32 
 
 		 426 aa  203  5e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  31.77 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  27.56 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  25.88 
 
 		 335 aa  126  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  26.02 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  25.91 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  26.88 
 
 		 335 aa  93.2  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  23.33 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  20.36 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  21.9 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  21.2 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  24.91 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  24.05 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  20.95 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  20.95 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  21.71 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  20.95 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  20.95 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  20.95 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  20.75 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  19.01 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  20.95 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  20.95 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  20.95 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  25 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  25.12 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  20.48 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  18.25 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  19.8 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  21.55 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  21.33 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  19.23 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  20.87 
 
 		 342 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  21.55 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  22.56 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  16.74 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1068  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.829956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  21.45 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>