17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1882 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1149    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  40.31 
 
 		 535 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  40.3 
 
 		 558 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  40.61 
 
 		 554 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  41.87 
 
 		 555 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  30.07 
 
 		 561 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  26.71 
 
 		 614 aa  176  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  24.44 
 
 		 565 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  23.98 
 
 		 505 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  22.78 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  22.1 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  21.24 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  23.43 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  20.2 
 
 		 492 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  23.78 
 
 		 568 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  22.22 
 
 		 476 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.3 
 
 		 892 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>