More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1847 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  66.85 
 
 		 531 aa  678    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  100 
 
 		 543 aa  1087    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.5 
 
 		 533 aa  548  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.05 
 
 		 533 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  54.76 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.67 
 
 		 533 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.3 
 
 		 533 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  53.88 
 
 		 530 aa  536  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  51.71 
 
 		 537 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  50 
 
 		 553 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  51.46 
 
 		 543 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  51.36 
 
 		 543 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  50.97 
 
 		 543 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  50.48 
 
 		 520 aa  482  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  50.7 
 
 		 527 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  48.36 
 
 		 526 aa  394  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.79 
 
 		 504 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  29.59 
 
 		 489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  29.79 
 
 		 489 aa  167  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.79 
 
 		 489 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  30.55 
 
 		 531 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.28 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.57 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0408  Na+/proline symporter-like protein  56.08 
 
 		 377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  26.26 
 
 		 489 aa  140  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  26.2 
 
 		 489 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  27.08 
 
 		 489 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  25.76 
 
 		 493 aa  137  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.33 
 
 		 488 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.99 
 
 		 506 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  26.13 
 
 		 486 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  27.1 
 
 		 483 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  26.99 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.68 
 
 		 492 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.06 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.65 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  24.49 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.38 
 
 		 493 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  25.38 
 
 		 493 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  25.38 
 
 		 493 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.65 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.65 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  25.48 
 
 		 483 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  25.7 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.51 
 
 		 483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  26.3 
 
 		 492 aa  134  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  26 
 
 		 483 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  28.57 
 
 		 518 aa  133  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.43 
 
 		 492 aa  133  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  27.27 
 
 		 544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.43 
 
 		 492 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  26.83 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.81 
 
 		 483 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  26.92 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  26.77 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  26.92 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.5 
 
 		 492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  25.43 
 
 		 492 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.85 
 
 		 492 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.75 
 
 		 492 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.75 
 
 		 492 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.75 
 
 		 492 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.75 
 
 		 492 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.75 
 
 		 492 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.54 
 
 		 492 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.81 
 
 		 484 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  25 
 
 		 497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.16 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  26.25 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.07 
 
 		 492 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.97 
 
 		 485 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  25.71 
 
 		 484 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  25.71 
 
 		 484 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  25.71 
 
 		 484 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.85 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  26.1 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.44 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  25.92 
 
 		 504 aa  125  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3408  sodium/proline symporter  27.43 
 
 		 497 aa  124  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4063  sodium/proline symporter  27.43 
 
 		 497 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.23 
 
 		 492 aa  124  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  27.75 
 
 		 499 aa  123  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  27.33 
 
 		 496 aa  123  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  26.16 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  26.16 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.81 
 
 		 493 aa  123  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  25.94 
 
 		 481 aa  123  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  25.29 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  25.29 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  24.61 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1291  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  25.29 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  27.41 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>