More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1820 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1820  NifC-like ABC-type porter  100 
 
 
261 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0980695  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1021  NifC-like ABC-type porter  54.18 
 
 
260 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  54.18 
 
 
260 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0923  NifC-like ABC-type porter  55.36 
 
 
260 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1306  molybdate ABC transporter, permease protein  52.99 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2783  ABC-type transport systems, permease component  52.8 
 
 
261 aa  231  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000474953  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  39.36 
 
 
270 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  39.76 
 
 
265 aa  192  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  45.12 
 
 
264 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  38.97 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  38.97 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  42.52 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  38.03 
 
 
266 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  37.56 
 
 
266 aa  163  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3448  NifC-like ABC-type porter  37.79 
 
 
269 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1583  NifC-like ABC-type porter  37.66 
 
 
257 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.583953  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
213 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  36.75 
 
 
288 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  35.85 
 
 
270 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
258 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000227965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.28 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  37 
 
 
269 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  32.95 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2207  NifC-like ABC-type porter  39.36 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.47 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  37.43 
 
 
225 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
269 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632399  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  37.36 
 
 
279 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  33.17 
 
 
222 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.81 
 
 
293 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.27 
 
 
221 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.51 
 
 
273 aa  122  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.8 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  31.62 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.92 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.61 
 
 
221 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.76 
 
 
230 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2747  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  30.38 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0056  tungstate/molybdate transport system permease protein  33.13 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  30.38 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  37.89 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.95 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.47 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 
224 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
260 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.92 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.65 
 
 
224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  37.55 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  35.24 
 
 
222 aa  115  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.39 
 
 
263 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  31.34 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  32.54 
 
 
224 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.22 
 
 
221 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  32.69 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  32.69 
 
 
224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.46 
 
 
226 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.69 
 
 
221 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.69 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 
224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  32.69 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  37.37 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  29.07 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  32.7 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  29.07 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  29.07 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.5 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  31.91 
 
 
263 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.07 
 
 
274 aa  112  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 
241 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34 
 
 
628 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.73 
 
 
275 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.2 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1388  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  32.47 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1376  sulfate ABC transporter permease protein CysT  31.31 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.97 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1021  NifC-like ABC-type porter  37.04 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.884483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.85 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  32.58 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1073  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysW  31.96 
 
 
310 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0403376  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  31.8 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.83 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1405  NifC-like ABC-type porter  34.82 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158337  normal  0.495211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02517  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.9 
 
 
270 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2498  NifC-like ABC-type porter  37.26 
 
 
244 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  33.78 
 
 
267 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02324  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.63 
 
 
277 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1255  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.63 
 
 
277 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2560  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.63 
 
 
277 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02285  hypothetical protein  28.63 
 
 
277 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.21 
 
 
485 aa  108  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103229  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.06 
 
 
226 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  35.26 
 
 
224 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>