More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1779 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 443 aa  904    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  51.82 
 
 		 445 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  50.56 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  48.24 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  44.5 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  43.8 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3335  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 		 474 aa  219  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  39.86 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  32.47 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  33.7 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  39.47 
 
 		 492 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  35.42 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  27.65 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  40.24 
 
 		 489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  40.53 
 
 		 529 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  43.52 
 
 		 489 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  42.59 
 
 		 489 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  35.18 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  30.97 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  35.92 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  39.3 
 
 		 493 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  33.92 
 
 		 504 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  34.98 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.09 
 
 		 479 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  38.66 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  33.83 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  31.51 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  29.27 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  35.25 
 
 		 284 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  36.28 
 
 		 284 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  31.73 
 
 		 262 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  33.07 
 
 		 278 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  32.79 
 
 		 285 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  34.1 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  31.74 
 
 		 282 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  32.39 
 
 		 280 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.11 
 
 		 264 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  27.17 
 
 		 481 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.77 
 
 		 268 aa  112  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  35.24 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  29.03 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  27.68 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  30.5 
 
 		 484 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  31.61 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  33.17 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  34.08 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  31.67 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  31.67 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  29.1 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  29.23 
 
 		 292 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  31.95 
 
 		 270 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  30.48 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 		 275 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  32.32 
 
 		 293 aa  104  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  27.02 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  32.5 
 
 		 487 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  27.11 
 
 		 474 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  30.48 
 
 		 640 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  34.22 
 
 		 550 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  30.5 
 
 		 604 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  29.57 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 489 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 489 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 489 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 489 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  29.32 
 
 		 294 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  31.67 
 
 		 480 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  32.21 
 
 		 312 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  34.02 
 
 		 485 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  31.3 
 
 		 265 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  31.47 
 
 		 476 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  28.46 
 
 		 493 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  30.83 
 
 		 489 aa  97.4  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  28.32 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 		 247 aa  97.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  33.67 
 
 		 485 aa  97.1  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  31.62 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  30.83 
 
 		 489 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  30.83 
 
 		 489 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  34.81 
 
 		 286 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  30.83 
 
 		 489 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 632 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 632 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  29.54 
 
 		 265 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  28.46 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  32.47 
 
 		 561 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 528 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 267 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  32.06 
 
 		 553 aa  94  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  30.42 
 
 		 262 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  31.5 
 
 		 268 aa  93.6  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  32.21 
 
 		 486 aa  94  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 		 275 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  25.66 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  34.86 
 
 		 358 aa  93.2  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  33.51 
 
 		 500 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>