More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1778 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  100 
 
 
448 aa  920    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  46.25 
 
 
435 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  44.06 
 
 
440 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  43.02 
 
 
433 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  43.34 
 
 
436 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  42.52 
 
 
448 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  42.25 
 
 
433 aa  351  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  41.59 
 
 
448 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  41.06 
 
 
453 aa  332  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  39.41 
 
 
435 aa  323  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  39.2 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  35.96 
 
 
434 aa  244  3e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  31.57 
 
 
457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  31.49 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  31.49 
 
 
457 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  31.64 
 
 
453 aa  196  9e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  30.91 
 
 
456 aa  192  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  31.21 
 
 
456 aa  190  4e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  31.67 
 
 
456 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  30.63 
 
 
459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  29.07 
 
 
431 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 
456 aa  176  9e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  51.02 
 
 
377 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  43.2 
 
 
367 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  28.09 
 
 
306 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.17 
 
 
375 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  45.54 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  37.5 
 
 
312 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  48.45 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  42.42 
 
 
309 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  45.36 
 
 
411 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  44 
 
 
404 aa  94.4  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44.33 
 
 
301 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  45.36 
 
 
379 aa  94.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  48.21 
 
 
372 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  45.36 
 
 
373 aa  93.6  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  45.36 
 
 
376 aa  93.2  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  44.33 
 
 
375 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  44.34 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  40.3 
 
 
273 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  40.3 
 
 
266 aa  91.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  46.32 
 
 
314 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  37.76 
 
 
294 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  45.83 
 
 
391 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.68 
 
 
286 aa  90.1  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  48.45 
 
 
448 aa  90.1  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  43 
 
 
431 aa  89.7  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  44 
 
 
400 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  38.81 
 
 
244 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  49.47 
 
 
541 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  47.42 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  44.9 
 
 
468 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  42 
 
 
441 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  38.6 
 
 
247 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  38.18 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  37.34 
 
 
336 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  41.58 
 
 
314 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  42.71 
 
 
392 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  39.1 
 
 
314 aa  87.4  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  31.25 
 
 
404 aa  87  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  38.61 
 
 
469 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  35.78 
 
 
308 aa  86.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  39.31 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  39 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  41.67 
 
 
392 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  42.27 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.86 
 
 
248 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  49 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  36.36 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  38.78 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  43.3 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  41.22 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  41.12 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  38.28 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  41.24 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  30.26 
 
 
269 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 
498 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  37.23 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.18 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  37.31 
 
 
490 aa  83.2  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  33.12 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  35.29 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  41 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  38.61 
 
 
295 aa  82.4  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  35.97 
 
 
255 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  44.33 
 
 
332 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  35.29 
 
 
471 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  39.8 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  42 
 
 
582 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  34.57 
 
 
285 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  41.24 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  36.84 
 
 
229 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  42.71 
 
 
460 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  39.6 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  40.21 
 
 
303 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  40.4 
 
 
302 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  41 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  42.31 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  38.14 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  39.18 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>