160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1738 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  100 
 
 		 572 aa  1172    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  53.25 
 
 		 572 aa  592  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  51.77 
 
 		 575 aa  566  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  49.83 
 
 		 584 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  49.21 
 
 		 580 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  47.82 
 
 		 582 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  41.39 
 
 		 575 aa  425  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  41.81 
 
 		 584 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  28.36 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  27.2 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  27.45 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  29.08 
 
 		 403 aa  107  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  27.61 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  26.15 
 
 		 403 aa  103  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  25.93 
 
 		 403 aa  101  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  25.99 
 
 		 403 aa  101  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  24.31 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  25.66 
 
 		 403 aa  94.4  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  27.65 
 
 		 426 aa  90.5  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  29.65 
 
 		 397 aa  89.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  26.83 
 
 		 750 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  25.99 
 
 		 769 aa  80.1  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  27.25 
 
 		 388 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  29.87 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  28.41 
 
 		 745 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  28.41 
 
 		 745 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  24.63 
 
 		 757 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  25.65 
 
 		 752 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  25.63 
 
 		 749 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  30.77 
 
 		 752 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  28.13 
 
 		 745 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  27.62 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  26.24 
 
 		 424 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  26.91 
 
 		 745 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.07 
 
 		 745 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  25.51 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  27.22 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  25.58 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  24.26 
 
 		 746 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  27.38 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  27.38 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  27.38 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  27.38 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  27.38 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  27.38 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  27.61 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  27.24 
 
 		 410 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  26 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  26 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  27.91 
 
 		 586 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.15 
 
 		 716 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  26 
 
 		 763 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  26 
 
 		 769 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  28 
 
 		 586 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  26 
 
 		 766 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  26 
 
 		 844 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  26.93 
 
 		 756 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  32.38 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  28.99 
 
 		 727 aa  63.9  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  28 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  28 
 
 		 597 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  29.21 
 
 		 611 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  30.28 
 
 		 736 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  28 
 
 		 586 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  27.16 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  25.9 
 
 		 555 aa  62  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  29.21 
 
 		 611 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  29.38 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  30.61 
 
 		 578 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  29.51 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  30.54 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  22.65 
 
 		 762 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  27.51 
 
 		 735 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  30.96 
 
 		 732 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  28.87 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  30.54 
 
 		 734 aa  58.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  26.82 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  26.46 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  27.3 
 
 		 391 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  30.67 
 
 		 734 aa  56.2  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  27.16 
 
 		 405 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  25.24 
 
 		 420 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  24.54 
 
 		 592 aa  55.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  31.4 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  25.53 
 
 		 420 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  29.88 
 
 		 728 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  28.03 
 
 		 728 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  28.81 
 
 		 728 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  28.03 
 
 		 742 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  28.33 
 
 		 728 aa  53.9  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  28.03 
 
 		 729 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  28.1 
 
 		 729 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  30.83 
 
 		 618 aa  53.9  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  27.35 
 
 		 728 aa  53.5  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  28.45 
 
 		 742 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  27.62 
 
 		 729 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  27.62 
 
 		 728 aa  53.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  28.45 
 
 		 742 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  27.62 
 
 		 729 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  26.57 
 
 		 727 aa  53.5  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>