79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1737 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  41.28 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  43.85 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  41.35 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  36.86 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  28.88 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  30.04 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  28.99 
 
 		 231 aa  88.6  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  27.12 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  27.32 
 
 		 235 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  31.82 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  27.44 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  29.19 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  26.47 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  31.34 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  30.86 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  29.09 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  27.34 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  32.4 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  29.76 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  29.68 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  27.7 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  22.91 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  24.84 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  30.25 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  32 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  33.06 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  25.54 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  33.59 
 
 		 566 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  40.68 
 
 		 414 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  28.31 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  25.17 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  25.17 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  25.17 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  27.96 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  25.17 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92228  predicted protein  26.04 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1457  O-methyltransferase family protein  32.38 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527749  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  43.94 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.94 
 
 		 340 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92615  predicted protein  35.71 
 
 		 321 aa  46.2  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0038468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  24.82 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  28.37 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.25 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3434  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  31.47 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  29.86 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  32.52 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  29.17 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  30.63 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  28.97 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  39.29 
 
 		 386 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4451  methyltransferase FkbM family  33.87 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0344893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  39.29 
 
 		 382 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  28.57 
 
 		 630 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47578  predicted protein  31.78 
 
 		 333 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  31.48 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  27.87 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  37.5 
 
 		 382 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  41.82 
 
 		 390 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1870  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.55 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  41.82 
 
 		 390 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  27.73 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  27.86 
 
 		 630 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  30.12 
 
 		 2082 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  24.67 
 
 		 338 aa  42.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 753 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.17 
 
 		 299 aa  42  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  28.79 
 
 		 216 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  30.39 
 
 		 378 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  29.69 
 
 		 255 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  30.97 
 
 		 220 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35002  predicted protein  35.16 
 
 		 302 aa  42  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>