More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1731 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
304 aa  627  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  64.98 
 
 
298 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  65.22 
 
 
300 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  63.97 
 
 
300 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  63.21 
 
 
300 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  54.36 
 
 
303 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  53.51 
 
 
305 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
303 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  52.68 
 
 
305 aa  332  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  55.3 
 
 
309 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  51.68 
 
 
303 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  51.52 
 
 
302 aa  328  7e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  50.34 
 
 
303 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
303 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
303 aa  321  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  51.86 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  51.29 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
321 aa  316  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 
307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 
309 aa  310  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 
306 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
298 aa  309  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  53.27 
 
 
309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  53.27 
 
 
309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.33 
 
 
302 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
309 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.66 
 
 
300 aa  305  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
315 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  47.33 
 
 
305 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  47.33 
 
 
305 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 
304 aa  300  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  46.98 
 
 
309 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 
306 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
306 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 
304 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 
303 aa  298  6e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 
309 aa  298  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 
355 aa  298  9e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
308 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 
301 aa  296  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  46.98 
 
 
309 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 
306 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
329 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 
309 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 
309 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 
309 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 
309 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 
309 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  50.85 
 
 
318 aa  295  9e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 
309 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 
309 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 
309 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  46.64 
 
 
309 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 
307 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 
304 aa  293  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  46.64 
 
 
309 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 
314 aa  293  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
308 aa  293  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 
312 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
302 aa  293  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
312 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 
310 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  50.84 
 
 
313 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 
306 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  46.05 
 
 
302 aa  291  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 
309 aa  291  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  48 
 
 
306 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 
309 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
311 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 
308 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 
309 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 
306 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 
309 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
312 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  46.31 
 
 
309 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  45 
 
 
326 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 
307 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
313 aa  289  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
312 aa  289  3e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  47.97 
 
 
303 aa  289  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  44.63 
 
 
307 aa  289  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  45.08 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  46.94 
 
 
318 aa  288  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
312 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  44.82 
 
 
306 aa  288  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
312 aa  288  6e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
311 aa  288  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 
326 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 
309 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
305 aa  288  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.46 
 
 
305 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  43.71 
 
 
309 aa  288  1e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 
323 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>