More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1729 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  76.56 
 
 		 403 aa  644    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  75.51 
 
 		 400 aa  634    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 407 aa  835    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  73.01 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  73.01 
 
 		 401 aa  614  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  66.92 
 
 		 401 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  66.24 
 
 		 403 aa  546  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  66.08 
 
 		 406 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  63.04 
 
 		 406 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  64.84 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  62.53 
 
 		 406 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  62.78 
 
 		 406 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  64.41 
 
 		 401 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  62.09 
 
 		 406 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  60.99 
 
 		 406 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  62.12 
 
 		 419 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  62.82 
 
 		 408 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  63.5 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  63.16 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  59.95 
 
 		 414 aa  515  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  61.03 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  60.66 
 
 		 405 aa  514  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  62.91 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  63.59 
 
 		 401 aa  511  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  63.18 
 
 		 405 aa  510  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  63.36 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  63.33 
 
 		 406 aa  501  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  59.16 
 
 		 410 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  59.8 
 
 		 408 aa  499  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  62.53 
 
 		 401 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  62.44 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  61.23 
 
 		 426 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  60.36 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  58.75 
 
 		 408 aa  494  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  59.64 
 
 		 411 aa  495  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  60.55 
 
 		 408 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  60.55 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  62.5 
 
 		 408 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  61.65 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  59.25 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  61.5 
 
 		 408 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1195  argininosuccinate synthase  63.57 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2970  argininosuccinate synthase  62.47 
 
 		 405 aa  498  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  61.65 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  58.69 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  61.77 
 
 		 419 aa  494  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  61.29 
 
 		 408 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  60.15 
 
 		 407 aa  498  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  61.96 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  62.5 
 
 		 408 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  60.55 
 
 		 416 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  60.61 
 
 		 407 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  59.61 
 
 		 409 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  61.96 
 
 		 413 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  61.96 
 
 		 413 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  63.01 
 
 		 408 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  58.25 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  60.41 
 
 		 403 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  58.88 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  59.24 
 
 		 402 aa  488  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  61.4 
 
 		 410 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  61.54 
 
 		 407 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  58.66 
 
 		 410 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  58.73 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  59.6 
 
 		 402 aa  488  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  62.4 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  61.21 
 
 		 409 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  59.9 
 
 		 404 aa  490  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  60.57 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  58.15 
 
 		 403 aa  487  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  61.36 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  59.85 
 
 		 402 aa  485  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  58.96 
 
 		 406 aa  485  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  60.86 
 
 		 409 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  58.56 
 
 		 407 aa  485  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  58.38 
 
 		 405 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  59.21 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  58.63 
 
 		 405 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  58.63 
 
 		 405 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  57.53 
 
 		 405 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  58.88 
 
 		 405 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  58.31 
 
 		 403 aa  482  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  60.2 
 
 		 409 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  58.59 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  56.9 
 
 		 409 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  59.9 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2883  argininosuccinate synthase  60.97 
 
 		 407 aa  481  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  59.39 
 
 		 409 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  59.6 
 
 		 406 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  59.6 
 
 		 406 aa  478  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  58.63 
 
 		 405 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  57.91 
 
 		 412 aa  479  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  58.56 
 
 		 410 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  58.27 
 
 		 405 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  57.84 
 
 		 409 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  58.4 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  58.42 
 
 		 409 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  57.92 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  58.04 
 
 		 408 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  59.85 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>