More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1728 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1728  argininosuccinate lyase  100 
 
 
470 aa  966    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.365452  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  65.72 
 
 
460 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  65.58 
 
 
460 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  63.97 
 
 
466 aa  609  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  65.5 
 
 
460 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0248  argininosuccinate lyase  64.33 
 
 
466 aa  597  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
458 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  53.02 
 
 
464 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  51.13 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
458 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  50.9 
 
 
462 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  50.89 
 
 
462 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  50.68 
 
 
462 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
462 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  50.89 
 
 
462 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  49.35 
 
 
462 aa  461  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  51.45 
 
 
456 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  50.34 
 
 
462 aa  461  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  50.68 
 
 
462 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  49.35 
 
 
461 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
458 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  50.68 
 
 
463 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
459 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
481 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  50.68 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  50.34 
 
 
460 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  50 
 
 
461 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  48.93 
 
 
488 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  52.6 
 
 
468 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 
459 aa  455  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  51.35 
 
 
464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0866  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  48.69 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  50.99 
 
 
475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  49 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  51.88 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  51.11 
 
 
468 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  50.76 
 
 
467 aa  451  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  46.48 
 
 
459 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
455 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  51.7 
 
 
464 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  48.8 
 
 
504 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  51.47 
 
 
499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  49.22 
 
 
458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  51.02 
 
 
464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 
458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  48.15 
 
 
461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  48.81 
 
 
465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  51.47 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  51.29 
 
 
478 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
464 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
463 aa  444  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  47.6 
 
 
462 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  50.68 
 
 
464 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  45.49 
 
 
461 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  51.12 
 
 
464 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
478 aa  441  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  51.25 
 
 
467 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
469 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  47.57 
 
 
458 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
467 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
468 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  50.9 
 
 
464 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
491 aa  444  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  51.01 
 
 
472 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
472 aa  438  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  52.23 
 
 
459 aa  438  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  47.32 
 
 
462 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
471 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  50 
 
 
461 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
466 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
470 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  48.16 
 
 
463 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
476 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
464 aa  441  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  48.13 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  48.01 
 
 
467 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  48.03 
 
 
466 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
457 aa  435  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  48.23 
 
 
466 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  49.02 
 
 
463 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  48.03 
 
 
493 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  48.25 
 
 
466 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 
465 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
493 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  47.94 
 
 
465 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
457 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  49.13 
 
 
459 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
467 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  48.81 
 
 
486 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  48.37 
 
 
465 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  47.77 
 
 
461 aa  438  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>