More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1723 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  73.91 
 
 		 449 aa  649    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  74.89 
 
 		 450 aa  694    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  75.11 
 
 		 450 aa  707    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  74.67 
 
 		 450 aa  691    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 450 aa  915    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  68 
 
 		 450 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  56 
 
 		 460 aa  527  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  54.85 
 
 		 454 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  55.03 
 
 		 454 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  54.46 
 
 		 453 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  54.69 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  55.33 
 
 		 451 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  54.42 
 
 		 454 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  54.42 
 
 		 451 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  54.53 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  55.28 
 
 		 452 aa  474  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  53.67 
 
 		 496 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  53.67 
 
 		 496 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  54.19 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  53.71 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  51.91 
 
 		 450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  52.44 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 465 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  51.46 
 
 		 450 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  53.12 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  55.84 
 
 		 447 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  51.63 
 
 		 451 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  53.59 
 
 		 483 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  52.47 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  50.79 
 
 		 450 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  52.13 
 
 		 452 aa  455  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  54.63 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  53.97 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  54.78 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  54.23 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  53.92 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_002620  TC0202  phosphoglucosamine mutase  48.65 
 
 		 459 aa  448  1e-125  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  53.67 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  54.06 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  52.81 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  53.27 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  53.83 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  54.17 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  53.27 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  53.23 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  53.97 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  52.47 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  51.69 
 
 		 448 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  53.72 
 
 		 450 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  54.91 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 		 449 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  51.91 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  52.71 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  47.99 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  51.8 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  48.31 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  50.68 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  52.21 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  48 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  50.45 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 		 446 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  51.4 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  51.4 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  50.23 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  48.31 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0705  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0611837  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  48.88 
 
 		 455 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  48.88 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  46.53 
 
 		 444 aa  408  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  48.21 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  49 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  46.1 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  47.66 
 
 		 451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  48.88 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  46.02 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  49.3 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  45.48 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  47.33 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  47 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  46.97 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  48.32 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  45.58 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  47.35 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  47.35 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  46.09 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  47.83 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  47.43 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  47.33 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  48.31 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  46.59 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>