More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1720 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1781  primosomal protein N'  52.15 
 
 		 792 aa  758    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1519  replication restart DNA helicase PriA  51.26 
 
 		 823 aa  771    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0061  primosomal protein N'  52.38 
 
 		 806 aa  768    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0259  primosomal protein N'  48.67 
 
 		 769 aa  715    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1711  primosomal protein N'  49.25 
 
 		 794 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1720  primosomal protein N'  100 
 
 		 778 aa  1571    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.31928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  33.8 
 
 		 804 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  36.16 
 
 		 758 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  32.13 
 
 		 732 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  35.77 
 
 		 752 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  36.14 
 
 		 754 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  41 
 
 		 813 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  35.37 
 
 		 752 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  31.73 
 
 		 801 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  32.91 
 
 		 781 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  34.01 
 
 		 801 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  35.23 
 
 		 732 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  34.65 
 
 		 738 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  30.98 
 
 		 802 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  32.04 
 
 		 745 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  32.88 
 
 		 809 aa  385  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  31.79 
 
 		 802 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  31.79 
 
 		 802 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  37.91 
 
 		 803 aa  380  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  35.62 
 
 		 751 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  31.43 
 
 		 801 aa  379  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  30.67 
 
 		 815 aa  376  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  30.2 
 
 		 801 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  34.24 
 
 		 743 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  30.41 
 
 		 796 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  30.42 
 
 		 801 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  30.42 
 
 		 801 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  30.29 
 
 		 801 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  34.54 
 
 		 746 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  30.42 
 
 		 801 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  35.08 
 
 		 745 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  30.42 
 
 		 801 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  35.1 
 
 		 739 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  30.08 
 
 		 801 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  41.83 
 
 		 730 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  35.98 
 
 		 801 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  38.95 
 
 		 775 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  30.92 
 
 		 724 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  37.59 
 
 		 810 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  36.03 
 
 		 801 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  34.64 
 
 		 739 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  29.89 
 
 		 798 aa  371  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  37.32 
 
 		 803 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  32.4 
 
 		 798 aa  372  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  35.69 
 
 		 810 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  35.23 
 
 		 740 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  33.2 
 
 		 746 aa  363  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  39.08 
 
 		 732 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  42.55 
 
 		 745 aa  362  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  40.45 
 
 		 828 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  30.31 
 
 		 731 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  32.52 
 
 		 723 aa  361  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  32.29 
 
 		 736 aa  361  4e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  33.51 
 
 		 739 aa  360  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  36.21 
 
 		 731 aa  360  6e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  30.28 
 
 		 730 aa  360  6e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  32.81 
 
 		 739 aa  360  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  34.37 
 
 		 661 aa  360  8e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  32.99 
 
 		 739 aa  359  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  32.99 
 
 		 739 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  33.75 
 
 		 733 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  32.94 
 
 		 739 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  35.57 
 
 		 815 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4126  primosomal protein N'  32.52 
 
 		 743 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000536083  hitchhiker  0.00000144445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  30.51 
 
 		 818 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  31.19 
 
 		 831 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  37.32 
 
 		 812 aa  357  5.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  36.85 
 
 		 747 aa  356  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  30.84 
 
 		 815 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  32.71 
 
 		 914 aa  355  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  40.15 
 
 		 731 aa  355  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  32.07 
 
 		 848 aa  354  4e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  34.86 
 
 		 744 aa  354  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  40.41 
 
 		 814 aa  353  5e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  27.79 
 
 		 790 aa  353  7e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  37.38 
 
 		 815 aa  353  7e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  36.91 
 
 		 749 aa  353  8.999999999999999e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2781  replication restart DNA helicase PriA  41.31 
 
 		 719 aa  352  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  39.62 
 
 		 858 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  35.79 
 
 		 810 aa  352  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  39.59 
 
 		 735 aa  351  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  38.72 
 
 		 744 aa  352  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  35.24 
 
 		 739 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  34.8 
 
 		 812 aa  351  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  33.29 
 
 		 732 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  32.65 
 
 		 732 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  32.38 
 
 		 768 aa  350  6e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  30.66 
 
 		 802 aa  350  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  31.69 
 
 		 815 aa  350  7e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  32.52 
 
 		 732 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  32.6 
 
 		 715 aa  349  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  30.7 
 
 		 824 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  40.87 
 
 		 805 aa  348  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  37.81 
 
 		 679 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  39.59 
 
 		 724 aa  348  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>