92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1694 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  100 
 
 		 1296 aa  2658    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  46.13 
 
 		 1288 aa  1090    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.02 
 
 		 1281 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  34.43 
 
 		 1946 aa  456  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.93 
 
 		 1686 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.82 
 
 		 1669 aa  312  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  29.51 
 
 		 1714 aa  308  6e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.32 
 
 		 1627 aa  302  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27 
 
 		 1590 aa  300  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.27 
 
 		 1482 aa  225  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.4 
 
 		 1270 aa  211  9e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  24 
 
 		 1014 aa  194  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1895 aa  179  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.26 
 
 		 1488 aa  158  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.06 
 
 		 1299 aa  157  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.78 
 
 		 1568 aa  148  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  26.74 
 
 		 991 aa  129  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  24.2 
 
 		 1470 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  27.14 
 
 		 1254 aa  111  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.95 
 
 		 1223 aa  106  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.59 
 
 		 1122 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.31 
 
 		 1227 aa  100  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1169 aa  99.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.76 
 
 		 1122 aa  97.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  24.73 
 
 		 1323 aa  95.1  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  26.36 
 
 		 1581 aa  94.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  23.08 
 
 		 1544 aa  93.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1169 aa  88.2  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.88 
 
 		 1181 aa  87.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  23.65 
 
 		 1521 aa  86.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  24.86 
 
 		 1309 aa  85.1  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.98 
 
 		 1030 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  23.34 
 
 		 1521 aa  83.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.04 
 
 		 1717 aa  82.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.8 
 
 		 1158 aa  81.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.4 
 
 		 1245 aa  81.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  22.71 
 
 		 1215 aa  79.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  22.9 
 
 		 1214 aa  78.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  22.71 
 
 		 1228 aa  78.2  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  21.52 
 
 		 1223 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.47 
 
 		 1204 aa  77  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  21.41 
 
 		 1223 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  22.71 
 
 		 1225 aa  77.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  22.46 
 
 		 1111 aa  77.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  21.32 
 
 		 1223 aa  77  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  25.49 
 
 		 1327 aa  75.5  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.37 
 
 		 1500 aa  75.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  23.06 
 
 		 1212 aa  73.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  25.17 
 
 		 1545 aa  73.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  21.11 
 
 		 1056 aa  72  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.04 
 
 		 1658 aa  71.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.21 
 
 		 1148 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.18 
 
 		 1115 aa  71.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.75 
 
 		 1676 aa  69.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.67 
 
 		 1168 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  24.48 
 
 		 1273 aa  68.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  29.06 
 
 		 1722 aa  68.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  25.72 
 
 		 1378 aa  67.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.45 
 
 		 1722 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.45 
 
 		 1723 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0672  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.03 
 
 		 1666 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0705474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.98 
 
 		 1168 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  25.72 
 
 		 1378 aa  67.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.69 
 
 		 1168 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.98 
 
 		 1168 aa  66.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.98 
 
 		 1169 aa  66.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.07 
 
 		 1168 aa  65.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  22.12 
 
 		 1127 aa  63.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.89 
 
 		 1154 aa  62.4  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.82 
 
 		 1155 aa  62  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  25.05 
 
 		 1493 aa  61.6  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.94 
 
 		 1148 aa  61.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  20.75 
 
 		 1204 aa  61.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.57 
 
 		 1205 aa  59.7  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  21.8 
 
 		 1186 aa  60.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.94 
 
 		 1177 aa  59.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.15 
 
 		 1355 aa  58.2  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.22 
 
 		 1287 aa  58.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  21.33 
 
 		 1014 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3479  hypothetical protein  24.76 
 
 		 596 aa  55.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1182 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  20.82 
 
 		 1194 aa  54.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  20.31 
 
 		 1201 aa  53.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.18 
 
 		 1190 aa  52.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  25.17 
 
 		 1069 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  24.63 
 
 		 1067 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  29.06 
 
 		 1200 aa  51.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  33.78 
 
 		 1361 aa  49.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  20.4 
 
 		 596 aa  48.9  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.61 
 
 		 1517 aa  48.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  22.15 
 
 		 1174 aa  46.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1132 aa  46.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>