165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1665 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
99 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  67.68 
 
 
100 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  62.63 
 
 
100 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  64.89 
 
 
100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  57.58 
 
 
100 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  62.63 
 
 
99 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  59.57 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  55.56 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  52.53 
 
 
105 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  49.49 
 
 
105 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  41.24 
 
 
97 aa  91.3  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  49.4 
 
 
94 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  41.67 
 
 
99 aa  90.1  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  39.39 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  42.27 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  42.27 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  46.05 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  40.21 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  36.56 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  42.5 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  42.5 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  41.46 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  39.76 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  48.33 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  43.01 
 
 
93 aa  66.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  43.01 
 
 
93 aa  66.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  47.76 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  45.9 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  41.33 
 
 
180 aa  63.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  36.71 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  40.51 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  35.63 
 
 
196 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  35 
 
 
197 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  34.48 
 
 
196 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  35.42 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  36.78 
 
 
196 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  35.37 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  34.15 
 
 
180 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  32.5 
 
 
197 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  32.56 
 
 
189 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 
196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 
196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
182 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  36.78 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  32.91 
 
 
178 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  34.48 
 
 
196 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  34.52 
 
 
182 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  28.57 
 
 
196 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 
182 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 
182 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  36.96 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 
183 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
182 aa  53.5  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  39.73 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  34.07 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  39.73 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  39.73 
 
 
213 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  36.51 
 
 
187 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  39.73 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  39.73 
 
 
213 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  39.73 
 
 
213 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  39.73 
 
 
213 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  39.73 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  35.9 
 
 
192 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 
180 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  27.37 
 
 
194 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 
182 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 
182 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  35.9 
 
 
193 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 
182 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 
182 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
187 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  36.71 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  36.71 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  36.71 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  36.71 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  36.71 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  36.71 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  36.71 
 
 
188 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  38.96 
 
 
187 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 
187 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 
184 aa  50.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  32.91 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>