More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1657 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  100 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  30 
 
 		 259 aa  91.7  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  45.63 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  38.18 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  34.13 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  38.98 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  43.3 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.14 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  46.24 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  32.14 
 
 		 582 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  42.55 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  29.07 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  41.41 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  41.41 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  36.17 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  40.45 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  33.33 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  41.57 
 
 		 390 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  37.36 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  30.57 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  36.11 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  39.33 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  35.71 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  38.3 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  35.71 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  42.53 
 
 		 565 aa  68.6  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  37.08 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  35.56 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  35.42 
 
 		 112 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.51 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  37.5 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  31.74 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.86 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  28.67 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  37.38 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  48.48 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  31.58 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  48.48 
 
 		 371 aa  65.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  50 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  40.26 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  30.77 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  35.44 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  40 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  31.25 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  34.23 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  34.91 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  39.24 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  34.19 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  26.3 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  39.36 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  41.46 
 
 		 115 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  30.56 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  31.4 
 
 		 700 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  36.36 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  35.9 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  30.84 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  30.84 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  37.66 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  37.66 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  34.44 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  37.18 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  35.9 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  39.74 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  35.9 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  33.33 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  34.09 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  34.88 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  41.77 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  30.09 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  41.56 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  30.84 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  46.67 
 
 		 340 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  34.57 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  33.33 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  37.35 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  37.18 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  34.78 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  32.56 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  35.35 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  35.29 
 
 		 391 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  32.26 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  33.33 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  31.53 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  34.88 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  35.44 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  44.16 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  29.63 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  39.24 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  32.91 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  34.62 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  31.86 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  34.18 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  37.18 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  39.18 
 
 		 865 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  37.33 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  37.04 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  28.57 
 
 		 614 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  34.57 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  31.65 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  35.8 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>