19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1649 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  568  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  53.85 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  52.42 
 
 		 272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  52.03 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  48.91 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  51.13 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  45.69 
 
 		 250 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  41.03 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  39.93 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  37.32 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  37.41 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  36.84 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  34.22 
 
 		 232 aa  123  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  29.63 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  32.48 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  28.52 
 
 		 296 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  30.9 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  30.25 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>