More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1645 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  64.16 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  58.3 
 
 		 278 aa  290  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  56.1 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  56.1 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  52.21 
 
 		 267 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  55.23 
 
 		 286 aa  279  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  54.07 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  54.39 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  54.07 
 
 		 303 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  54.07 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  54.07 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  53.14 
 
 		 291 aa  275  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  54.55 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  54.96 
 
 		 259 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  57.64 
 
 		 263 aa  271  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  52.5 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  53.25 
 
 		 306 aa  268  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  53.31 
 
 		 259 aa  268  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  54.13 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  52.19 
 
 		 272 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  52.85 
 
 		 304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.6 
 
 		 254 aa  267  8.999999999999999e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  54.17 
 
 		 264 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  51.26 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  52.63 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  49.6 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  50.83 
 
 		 292 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.21 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  50.2 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  54.55 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  56.71 
 
 		 251 aa  264  8e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  54.39 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  51.24 
 
 		 259 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  51.65 
 
 		 259 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 		 253 aa  261  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  53.91 
 
 		 267 aa  259  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  51.84 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  51.84 
 
 		 267 aa  258  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  51.61 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  53.95 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  51.67 
 
 		 282 aa  254  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  53.11 
 
 		 272 aa  254  9e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  49.8 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  52.08 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  56.28 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  56.28 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  56.28 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  50.4 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  49.59 
 
 		 307 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  52.4 
 
 		 271 aa  251  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  53.04 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  46.4 
 
 		 271 aa  251  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  51.44 
 
 		 283 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  51.58 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  48.79 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  51.22 
 
 		 315 aa  248  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  50.8 
 
 		 259 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  50.41 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.72 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  53.11 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  53.11 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  47.76 
 
 		 303 aa  246  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  50.86 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  48.39 
 
 		 276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  51.49 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  54.08 
 
 		 288 aa  244  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  48.98 
 
 		 269 aa  244  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  51.72 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  51.3 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  47.98 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  52.44 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  50.66 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  50.59 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  47.6 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  49.8 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  53.74 
 
 		 257 aa  241  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.73 
 
 		 260 aa  241  6e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  51.79 
 
 		 279 aa  241  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  50.2 
 
 		 268 aa  241  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  50 
 
 		 275 aa  241  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  52.07 
 
 		 260 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  49.8 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  49.39 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 264 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  52.02 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.8 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  50.64 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.03 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.61 
 
 		 274 aa  238  8e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.875823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>