209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1644 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  100 
 
 
164 aa  342  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  68.12 
 
 
164 aa  233  1e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  65.24 
 
 
164 aa  224  5e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  65.43 
 
 
164 aa  223  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  64.42 
 
 
167 aa  219  2e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  62.42 
 
 
165 aa  203  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  3.83486e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  58.9 
 
 
168 aa  199  2e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  59.01 
 
 
168 aa  198  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  58.13 
 
 
163 aa  197  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  60.51 
 
 
168 aa  196  1e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  57.76 
 
 
165 aa  190  9e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  57.14 
 
 
168 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.01822e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  61.96 
 
 
169 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  57.58 
 
 
165 aa  187  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  56.6 
 
 
172 aa  185  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  53.94 
 
 
166 aa  181  4e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  54.55 
 
 
165 aa  180  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  53.33 
 
 
166 aa  180  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  56.36 
 
 
166 aa  178  3e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  53.33 
 
 
166 aa  178  3e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  54.55 
 
 
166 aa  176  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  60.51 
 
 
163 aa  175  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  52.17 
 
 
165 aa  175  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  55.15 
 
 
166 aa  174  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  57.52 
 
 
166 aa  172  2e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.42552e-33 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  52.17 
 
 
165 aa  172  2e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  57.52 
 
 
166 aa  172  2e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  51.25 
 
 
165 aa  170  7e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  55.56 
 
 
166 aa  170  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  53.85 
 
 
166 aa  168  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  51.85 
 
 
166 aa  168  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  53.94 
 
 
166 aa  167  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  52.73 
 
 
166 aa  167  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  56.95 
 
 
164 aa  164  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.60498e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  53.33 
 
 
166 aa  164  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  50.3 
 
 
165 aa  163  1e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  51.23 
 
 
166 aa  162  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  50.62 
 
 
166 aa  157  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  49.38 
 
 
166 aa  156  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  51.61 
 
 
158 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  47.9 
 
 
184 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  47.16 
 
 
185 aa  144  7e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  46.75 
 
 
167 aa  141  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  46.91 
 
 
167 aa  139  1e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.49666e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  48.15 
 
 
173 aa  139  1e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  42.05 
 
 
184 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  45.96 
 
 
170 aa  135  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  43.79 
 
 
182 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  43.21 
 
 
169 aa  134  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  45.96 
 
 
170 aa  134  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  2.07736e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  45.96 
 
 
170 aa  134  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  47.71 
 
 
168 aa  134  6e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.46492e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  39.41 
 
 
184 aa  132  2e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  41.88 
 
 
166 aa  130  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  51.49 
 
 
140 aa  129  2e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  46.63 
 
 
168 aa  129  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  43.6 
 
 
185 aa  127  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  44.97 
 
 
182 aa  126  2e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  40.45 
 
 
182 aa  125  4e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  43.31 
 
 
167 aa  125  4e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.56568e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  38.64 
 
 
184 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  43.12 
 
 
169 aa  124  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  50.39 
 
 
140 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  42.22 
 
 
182 aa  122  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  45.24 
 
 
179 aa  119  1e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  50 
 
 
168 aa  119  2e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  49.62 
 
 
140 aa  119  2e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7438e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  42.24 
 
 
228 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98251e-06 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  46.43 
 
 
178 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  49.62 
 
 
139 aa  118  4e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  3.45358e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  41.92 
 
 
233 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  43.48 
 
 
167 aa  117  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.23416e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  44.31 
 
 
178 aa  117  8e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  48.84 
 
 
140 aa  116  2e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  48.09 
 
 
139 aa  115  2e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  48.09 
 
 
140 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  40.83 
 
 
178 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  48.09 
 
 
140 aa  114  7e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  47.33 
 
 
139 aa  114  7e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  6.55626e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  48.09 
 
 
140 aa  114  7e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  48.09 
 
 
140 aa  114  7e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  46.92 
 
 
139 aa  113  1e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  43.45 
 
 
179 aa  113  1e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  47.69 
 
 
140 aa  113  1e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  112  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  112  2e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  47.69 
 
 
140 aa  112  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  47.69 
 
 
139 aa  112  2e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  112  2e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  112  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  112  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  112  2e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  112  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  112  2e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  42.6 
 
 
179 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  42.6 
 
 
179 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  47.33 
 
 
140 aa  111  4e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  110  7e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  48.84 
 
 
139 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  39.75 
 
 
166 aa  109  1e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>