149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1627 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 221 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  94.12 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  38.83 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  43.35 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  44.29 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  43.95 
 
 		 156 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  44 
 
 		 148 aa  116  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  37.36 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  43.85 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  40.96 
 
 		 171 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  41.61 
 
 		 182 aa  111  9e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  34.62 
 
 		 153 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  31.42 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  35.02 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  41.79 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  34.67 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  35.07 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  36.99 
 
 		 153 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  36.99 
 
 		 187 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  36.31 
 
 		 153 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  39.46 
 
 		 179 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  32.5 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  35.26 
 
 		 164 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  35.37 
 
 		 175 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.92 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  32.47 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  31.58 
 
 		 175 aa  93.6  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.99 
 
 		 175 aa  92.8  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.93 
 
 		 169 aa  93.2  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.99 
 
 		 175 aa  92  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  40.15 
 
 		 153 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  37.06 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  35.62 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  37.31 
 
 		 157 aa  86.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  34.35 
 
 		 185 aa  86.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  38.69 
 
 		 150 aa  85.9  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  38.35 
 
 		 134 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  31.64 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  31.74 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  34.72 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  34.06 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  33.54 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  34.67 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  34.81 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  34 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  37.5 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  28.88 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  31.37 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  34.36 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  31.54 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  30.06 
 
 		 162 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  34.78 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  35 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  31.72 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  33.54 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  32.05 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  37.76 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  34.46 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  28.66 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  30.88 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  31.65 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  32.17 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  29.72 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  35.07 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  33.79 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  30.86 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  32.84 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.48 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0403  nuclease (SNase domain protein)  26.21 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  29.12 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  31.97 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  30.5 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  29.67 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  31.48 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  34.62 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  31.14 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  31.97 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  31.21 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  65.91 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  31.14 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  29.19 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  32.48 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.4 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  30.3 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30.07 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  35.29 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  31.78 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  31.78 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  29.87 
 
 		 164 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  30 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  30 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  31.41 
 
 		 534 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  31.3 
 
 		 333 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28.07 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  27.94 
 
 		 351 aa  52  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  31.43 
 
 		 175 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  25.44 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  27.45 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  30.94 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  28.1 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>