189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1622 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 780 aa  1610    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  42.81 
 
 		 843 aa  629  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  43.88 
 
 		 828 aa  614  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  39.36 
 
 		 873 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5312  hypothetical protein  32.42 
 
 		 625 aa  161  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2872  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  26.09 
 
 		 1209 aa  143  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4478  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.52 
 
 		 967 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0051  CRISPR-associated HD domain-containing protein  29.35 
 
 		 921 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3147  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  28.12 
 
 		 893 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  26.16 
 
 		 933 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  31.47 
 
 		 799 aa  106  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  25.13 
 
 		 737 aa  91.7  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  25.73 
 
 		 548 aa  87  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  29.35 
 
 		 850 aa  87.4  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4850  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  23.85 
 
 		 1096 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.829455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  27.25 
 
 		 763 aa  85.1  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  27.5 
 
 		 859 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  27.02 
 
 		 726 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  27.62 
 
 		 783 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  25.14 
 
 		 776 aa  79  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  24.79 
 
 		 762 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  25.98 
 
 		 721 aa  78.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 		 1027 aa  78.2  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  25.06 
 
 		 821 aa  77.8  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  23.86 
 
 		 765 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  37.01 
 
 		 729 aa  77  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  27.07 
 
 		 854 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  38.83 
 
 		 736 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  39.64 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  26.1 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  26.94 
 
 		 804 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  25.81 
 
 		 827 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.18 
 
 		 488 aa  73.9  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  23.03 
 
 		 801 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  27.4 
 
 		 779 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  32.51 
 
 		 750 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 		 781 aa  72.8  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  25.21 
 
 		 566 aa  70.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  26.36 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  25.12 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  23.16 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  23.45 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  21.7 
 
 		 822 aa  68.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.62 
 
 		 820 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  26.27 
 
 		 783 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.82 
 
 		 929 aa  68.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  36.84 
 
 		 962 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27 
 
 		 892 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  32.85 
 
 		 922 aa  66.6  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  32.73 
 
 		 729 aa  66.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  23.81 
 
 		 834 aa  65.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  31.54 
 
 		 764 aa  65.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  28.79 
 
 		 899 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.13 
 
 		 775 aa  65.1  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  29.79 
 
 		 811 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  28.99 
 
 		 901 aa  65.1  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.16 
 
 		 824 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  37.74 
 
 		 933 aa  64.7  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  23.28 
 
 		 651 aa  64.7  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  33.33 
 
 		 905 aa  64.7  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  29.27 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  32.67 
 
 		 744 aa  64.3  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  23.67 
 
 		 880 aa  64.3  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  39.39 
 
 		 566 aa  63.9  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  33.04 
 
 		 582 aa  63.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  24.62 
 
 		 948 aa  63.5  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  25.29 
 
 		 829 aa  63.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  28.33 
 
 		 807 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  31.75 
 
 		 944 aa  62.4  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  36.36 
 
 		 920 aa  62  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.42 
 
 		 885 aa  62  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  32.17 
 
 		 823 aa  61.6  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  29.1 
 
 		 795 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  23.7 
 
 		 860 aa  62  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  24.43 
 
 		 804 aa  61.6  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  24.94 
 
 		 801 aa  61.6  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  25.3 
 
 		 871 aa  61.2  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  25.21 
 
 		 805 aa  60.8  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  37.18 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  24.71 
 
 		 732 aa  60.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.65 
 
 		 1540 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  35.71 
 
 		 887 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  24.36 
 
 		 943 aa  60.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  25.92 
 
 		 868 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  32.54 
 
 		 881 aa  58.9  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  32.74 
 
 		 917 aa  58.9  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  36.45 
 
 		 836 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  33.06 
 
 		 781 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  33.65 
 
 		 888 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  24.71 
 
 		 904 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  33.65 
 
 		 888 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.62 
 
 		 885 aa  58.2  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.3 
 
 		 970 aa  57.4  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  25.74 
 
 		 832 aa  57  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  24.93 
 
 		 722 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.98 
 
 		 1534 aa  57  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  24.14 
 
 		 871 aa  57  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  26.22 
 
 		 857 aa  57  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  28.09 
 
 		 791 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  22.8 
 
 		 778 aa  56.2  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>