32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1612 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  100 
 
 		 866 aa  1805    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  34.3 
 
 		 650 aa  287  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  31.97 
 
 		 535 aa  240  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  32.51 
 
 		 576 aa  239  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  34.07 
 
 		 521 aa  232  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  32.57 
 
 		 746 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  28.81 
 
 		 739 aa  217  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  30.96 
 
 		 701 aa  210  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  30.25 
 
 		 636 aa  205  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  32.66 
 
 		 399 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  29.59 
 
 		 572 aa  197  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  31.49 
 
 		 643 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  29.98 
 
 		 685 aa  191  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  29.64 
 
 		 880 aa  187  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  27.73 
 
 		 545 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  28.57 
 
 		 427 aa  161  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  27.73 
 
 		 525 aa  153  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  29.14 
 
 		 377 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  27.94 
 
 		 820 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  30.35 
 
 		 987 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  26.72 
 
 		 317 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  22.81 
 
 		 1039 aa  60.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  25.48 
 
 		 825 aa  55.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  28.57 
 
 		 874 aa  55.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  28.57 
 
 		 874 aa  55.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1980  hypothetical protein  26.87 
 
 		 405 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.576893 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1027 aa  51.6  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  28.86 
 
 		 769 aa  50.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  26.12 
 
 		 1061 aa  50.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  25.26 
 
 		 1036 aa  48.9  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0907  Zn-finger, CHC2 type  23.24 
 
 		 1098 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  26.76 
 
 		 796 aa  47  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>